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amber mmpbsa 长度与能量不匹配问题
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用mmpbsa.py计算自由能 当算到pb的ligand的时候报错 File "/opt/apps/amber16/bin/MMPBSA.py", line 108, in <module> app.parse_output_files() File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/main.py", line 944, in parse_output_files self.INPUT['verbose'], self.using_chamber) File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1007, in __init__ self.delta2() File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1234, in delta2 self.com.fill_composite_terms() File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 372, in fill_composite_terms self.data[component] = self.data[key] + self.data[component] File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 61, in __add__ raise LengthError('length mismatch in energy vectors')LengthError: length mismatch in energy vectors 这个是哪里出了问题该如何解决呢？ 谢谢帮助指导！！ 发自小木虫Android客户端 |
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枫樰微飓
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2楼2021-10-04 18:55:20