24小时热门版块排行榜    

查看: 1130  |  回复: 1
【悬赏金币】回答本帖问题,作者lily49将赠送您 10 个金币

lily49

新虫 (初入文坛)

[求助] amber mmpbsa 长度与能量不匹配问题

用mmpbsa.py计算自由能
当算到pb的ligand的时候报错
File "/opt/apps/amber16/bin/MMPBSA.py", line 108, in <module>    app.parse_output_files()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/main.py", line 944, in parse_output_files    self.INPUT['verbose'], self.using_chamber)  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1007, in __init__    self.delta2()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1234, in delta2    self.com.fill_composite_terms()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 372, in fill_composite_terms    self.data[component] = self.data[key] + self.data[component]  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 61, in __add__    raise LengthError('length mismatch in energy vectors')LengthError: length mismatch in energy vectors
这个是哪里出了问题该如何解决呢?
谢谢帮助指导!!

发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枫樰微飓

新虫 (小有名气)

楼主解决问题了吗?我也遇到同样问题

发自小木虫Android客户端
2楼2021-10-04 18:55:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lily49 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
信息提示
请填处理意见