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lily49

新虫 (初入文坛)

[求助] amber mmpbsa 长度与能量不匹配问题

用mmpbsa.py计算自由能
当算到pb的ligand的时候报错
File "/opt/apps/amber16/bin/MMPBSA.py", line 108, in <module>    app.parse_output_files()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/main.py", line 944, in parse_output_files    self.INPUT['verbose'], self.using_chamber)  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1007, in __init__    self.delta2()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 1234, in delta2    self.com.fill_composite_terms()  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 372, in fill_composite_terms    self.data[component] = self.data[key] + self.data[component]  File "/opt/apps/amber16/lib/python2.7/site-packages/MMPBSA_mods/amber_outputs.py", line 61, in __add__    raise LengthError('length mismatch in energy vectors')LengthError: length mismatch in energy vectors
这个是哪里出了问题该如何解决呢?
谢谢帮助指导!!

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枫樰微飓

新虫 (小有名气)

楼主解决问题了吗?我也遇到同样问题

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2楼2021-10-04 18:55:20
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