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百斤四

新虫 (初入文坛)

[求助] VMD计算成氢建分子的坐标

我是做环肽纳米管的,进来看到一篇做CNT文献,想做类似的分析,但苦于我只能用VMD插件输出氢建个数,却无法得到成氢健分子的坐标,查看教程好几天看到measure hbonds 命令,但苦于脚本还是调试失败,不知道有没有人用过类似的脚本,可以借来参考一下,小妹感激不尽,谢谢大家

VMD计算成氢建分子的坐标


VMD计算成氢建分子的坐标-1


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chuntao118

新虫 (著名写手)

坐标输出应该很容易吧!我没有用软件,但坐标输出肯定不难!自己写程序也就是个输出语句而异!

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2楼2017-07-21 11:42:45
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百斤四

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2017-07-21 11:42:45
坐标输出应该很容易吧!我没有用软件,但坐标输出肯定不难!自己写程序也就是个输出语句而异!

好像没有你说的那么容易,

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3楼2017-07-23 01:15:16
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百斤四

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2017-07-21 11:42:45
坐标输出应该很容易吧!我没有用软件,但坐标输出肯定不难!自己写程序也就是个输出语句而异!

不过你要是大神的话,那肯定就很容易了

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4楼2017-07-23 01:15:38
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ljldeath

新虫 (初入文坛)

问一下亲怎么用vmd计算氢键呢

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5楼2017-11-22 13:26:00
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1040720479

新虫 (小有名气)

请问楼主可以私聊帮我看看脚本怎么改嘛

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6楼2021-12-07 20:56:35
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