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求助做分子对接之后的分析软件 已有1人参与
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用ds的zdock对接完成的蛋白复合物进行分析的软件有哪些啊？就是能够分析出对接位置氨基酸能量的软件。我看好多都是需要amber中的mmgasp包。ambertools可以么？ 发自小木虫IOS客户端 |
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4楼2018-03-20 15:28:00
5楼2018-03-20 15:47:47
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你好。我还想问一下就是zdock对接之后得到的构像有很多个。我是需要选择最优的还是说随便一个复合物进行分子动力学呢？怎么把两个蛋白单独的pdb文件整合在一起呢？因为用ds对接之后的复合物保存的pdb文件就只有原子的位置。就连基本的折叠跟螺旋结构都没有了。那可以用这个pdb跑分子动力学 么？ 发自小木虫IOS客户端 |
6楼2018-05-17 15:36:16
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