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abigrabbit

金虫 (初入文坛)

[求助] 不同PH值,gromacs 模拟

文献报道,常见模拟蛋白在不同的PH下面,但是模拟PH要考虑残基质子化,带电性问题;有没有类似网站能提供,在不同PH值下面,质子化的残基,及其带电性???
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-10-20 12:21:46
H++ Server or PROPKA, you can search for these server using google
2楼2012-10-20 11:41:32
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小许高年级

新虫 (初入文坛)

您好,老师。请问您现在解决了gromacs中pH的设置问题吗?我现在想探索pH值为7.5和6.5状态下蛋白的构象影响,但是遇到pH,不知道那一步来设置。若您知晓,麻烦告知。谢谢!
MD小白
3楼2021-06-08 19:38:52
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