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ruthxu

金虫 (正式写手)

[求助] 用gromacs如何实现 zero tension simulation

在模拟膜的过程中,经常会用到a zero tension simulation, 想请教一下大家有没有模拟膜用到过这个条件,是如何实现的?
谢谢!
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Betterlatethannever!
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匿名

用户注销 (著名写手)

本帖仅楼主可见
2楼2011-08-26 11:19:06
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-26 20:05:59
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-26 20:06:19
ruthxu(金币+3): 2011-08-27 22:13:35
ruthxu(金币+7): 2011-09-01 19:17:33
引用回帖:
1楼: Originally posted by ruthxu at 2011-08-25 17:18:12:
在模拟膜的过程中,经常会用到a zero tension simulation, 想请教一下大家有没有模拟膜用到过这个条件,是如何实现的?
谢谢!

膜的张力由projected area per lipid决定。有了这个关键性的提示,你自己思考下怎么样才能改变projected area per lipd。
3楼2011-08-26 18:34:25
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ruthxu

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yahoohoo at 2011-08-26 18:34:25:
膜的张力由projected area per lipid决定。有了这个关键性的提示,你自己思考下怎么样才能改变projected area per lipd。

我可能没有问清楚,在gromacs压力耦合中,耦合方式semiisotropic,在模拟膜的时候,xy平面的压力和z方向的压力如何设置,才是zero tension simulation?
Betterlatethannever!
4楼2011-08-27 22:21:55
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yahoohoo

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ruthxu at 2011-08-27 22:21:55:
我可能没有问清楚,在gromacs压力耦合中,耦合方式semiisotropic,在模拟膜的时候,xy平面的压力和z方向的压力如何设置,才是zero tension simulation?

我不用gromacs,不清楚了。
5楼2011-08-28 14:12:48
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dubo

金虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
4楼: Originally posted by ruthxu at 2011-08-27 22:21:55:
我可能没有问清楚,在gromacs压力耦合中,耦合方式semiisotropic,在模拟膜的时候,xy平面的压力和z方向的压力如何设置,才是zero tension simulation?

师姐,做的这么先进啊,哈哈...

我只知道GROMACS的semiisotropic是在xy方向上用的同一个压力和压缩系数,不知道你的zero tension simulation 是什么含义。哈哈
6楼2011-08-28 22:43:06
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stephone

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-04 19:34:18
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wj925806

铜虫 (小有名气)

这个问题我现在也遇到了,大家是怎么处理的啊?
8楼2012-05-14 20:54:12
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budgerigar

木虫 (小有名气)

同求助,不知道各位如何处理这种情况呢,多谢了
9楼2012-06-02 11:16:36
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