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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【分子动力学模拟】gromacs进行六个不同多肽自组装
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新虫 (初入文坛)

[求助] 【分子动力学模拟】gromacs进行六个不同多肽自组装

我想用gromacs进行六个不同多肽自组装的模拟，但是不知道第一步该如何建模，我已经得到这六个小分子肽的pdb结构，不知道怎么在gromacs中将他们随机放进一个盒子里面，因为刚学习MD不久，还不太懂，我目前知道可以用gromacs生成一个肽的gro，然后用自带editconf建立盒子，但是不知道如何将六个不同的肽随机放进一个盒子里面。谢谢大家啦！

@smutao @oxox6085 发自小木虫Android客户端
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1楼 2021-12-10 14:20:52
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