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luckycao

金虫 (小有名气)

[求助] 关于mmpbsa 错误,求指导:PrmtopError 已有1人参与

MMPBSA.py -O -i mmpbsa.in -o FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat -sp com_wat.prmtop -cp com.prmtop -rp rec.prmtop -lp lig.prmtop -y ../prod3.mdcrd -do decomp.dat -eo energy.csv -deo dec_energies.csv &
这是我运行的命令
出错信息如下:
Reading command-line arguments and input files...
Loading and checking parameter files for compatibility...
PrmtopError: Complex natom != receptor natom + ligand natom
Exiting. All files have been retained.
希望能得到解决啊
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jjlex

木虫 (正式写手)

错误信息很清楚呀,top文件有问题,你要确保给正确的top给mmpbsa

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-03-14 21:02:10
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lihong9639

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

拓扑有问题,原子数不一样
3楼2021-11-05 15:40:23
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