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zhangduo2016

新虫 (正式写手)

[求助] namd运行出错,求各位大神帮助

各位大神真心求助,我的namd运行出错了,提示:FATAL ERROR: DIDN'T FIND vdW PARAMETER FOR ATOM TYPE HB1。我查看了生成PSF文件前的pdb文件中没有HB1,但用VMD自动生成psf文件后的pdb文件中有HB1,然而其psf文件中没有找到HB1。我想知道我是哪一步出错了?修改psf文件的话具体如何修改?真心求助!妹子在此万分感谢了!
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阳光记忆

新虫 (初入文坛)

遇到同样的问题,请问楼主该问题解决了没有,请赐教啦
2楼2017-10-11 10:25:49
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吓吓夏夏夏

新虫 (正式写手)

3楼2019-08-19 10:34:32
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yibaigui

铁虫 (正式写手)

.conf 或者.namd 文件里的parameter 的路径文件太久或者缺失了。需要尝试添加完整或最新版。

发自小木虫IOS客户端
放松,轻松,
4楼2020-11-03 13:00:23
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