24小时热门版块排行榜    

查看: 2145  |  回复: 3

zhangduo2016

新虫 (正式写手)

[求助] namd运行出错,求各位大神帮助

各位大神真心求助,我的namd运行出错了,提示:FATAL ERROR: DIDN'T FIND vdW PARAMETER FOR ATOM TYPE HB1。我查看了生成PSF文件前的pdb文件中没有HB1,但用VMD自动生成psf文件后的pdb文件中有HB1,然而其psf文件中没有找到HB1。我想知道我是哪一步出错了?修改psf文件的话具体如何修改?真心求助!妹子在此万分感谢了!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

阳光记忆

新虫 (初入文坛)

遇到同样的问题,请问楼主该问题解决了没有,请赐教啦
2楼2017-10-11 10:25:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

吓吓夏夏夏

新虫 (正式写手)

3楼2019-08-19 10:34:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yibaigui

铁虫 (正式写手)

.conf 或者.namd 文件里的parameter 的路径文件太久或者缺失了。需要尝试添加完整或最新版。

发自小木虫IOS客户端
放松,轻松,
4楼2020-11-03 13:00:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhangduo2016 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 285求调剂 +6 ytter 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:05 by njzyff
[考研] 309求调剂 +5 花与叶@ 2026-03-10 5/250 2026-03-16 14:13 by 哦哦123
[考研] 环境工程调剂 +4 大可digkids 2026-03-16 4/200 2026-03-16 14:00 by laoshidan
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 344求调剂 +3 knight344 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:42 by 无际的草原
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +6 一鸭鸭哟 2026-03-14 7/350 2026-03-15 22:12 by Winj1e
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 279求调剂 +3 Dizzy123@ 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:02 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕288分求调剂 一志愿211 +4 在家想你 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:49 by JourneyLucky
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 298求调剂 +3 Vv呀! 2026-03-10 3/150 2026-03-10 22:40 by 剑诗杜康
信息提示
请填处理意见