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[求助]
急求助！！amber和WHAM的问题，自由能曲面 已有1人参与
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求助各位仁兄！ 我用amber进行了REMD的模拟，一个蛋白质，26个温度副本。现在想得到自由能曲面，用WHAM的方法，Grossfield Lab的。那么这个网站提供的这个程序怎么安装在我的电脑上呢？有没有同学装过？它的说明书安装好简单，我照做了还是键入wham-2D命令没有办法启动。我想得到三维的自由能曲面，两个坐标分别为Rg，RMSD。那么WHAM中的metadatafile的输入文件我要怎么写，怎么处理得到的amber的输出文件才能实现这个目的？有哪位高手做过的吗？跪求指导！谢谢！ |
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