| 查看: 757 | 回复: 0 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者L4Bo2将赠送您 50 个金币 | ||
[求助]
packmol建模后优化结构原子坐标为0
|
||
|
我用packmol建了一个三元体系，后面nve/limit或npt弛豫后，第2，3种原子在write_data出的坐标文件中位置都为0，in文件这样 echo screen units metal boundary p p p atom_style atomic read_data 042 #mass 1 56 #mass 2 48 #mass 3 16 #pair_style soft 2.5 #pair_coeff * * 5.0 pair_style eam/alloy pair_coeff * * FeTiO.lammps.EAM Fe Ti O timestep 0.001 thermo 100 group a type 1 group b type 2 3 fix 1 all nve/limit 0.5 run 100000 every 1 "set group b vx 0.0 vy 0.0 vz 0.0" unfix 1 #fix 1 all npt temp 2500 2500 0.1 iso 0.0 0.0 10.0 #run 100000 every 1 "set type 2*3 vx 0.0 vy 0.0 vz 0.0" #unfix 1 write_data 043 |
回复此楼» 猜你喜欢
参与限项
已经有3人回复
-
假如你的研究生提出不合理要求
已经有7人回复
-
实验室接单子
已经有4人回复
-
全日制（定向）博士
已经有4人回复
-
对氯苯硼酸纯化
已经有3人回复
-
求助:我三月中下旬出站，青基依托单位怎么办？
已经有12人回复
-
不自信的我
已经有12人回复
-
所感
已经有4人回复
-
要不要辞职读博？
已经有7人回复
-
北核录用
已经有3人回复