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packmol建模后优化结构原子坐标为0
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我用packmol建了一个三元体系，后面nve/limit或npt弛豫后，第2，3种原子在write_data出的坐标文件中位置都为0，in文件这样 echo screen units metal boundary p p p atom_style atomic read_data 042 #mass 1 56 #mass 2 48 #mass 3 16 #pair_style soft 2.5 #pair_coeff * * 5.0 pair_style eam/alloy pair_coeff * * FeTiO.lammps.EAM Fe Ti O timestep 0.001 thermo 100 group a type 1 group b type 2 3 fix 1 all nve/limit 0.5 run 100000 every 1 "set group b vx 0.0 vy 0.0 vz 0.0" unfix 1 #fix 1 all npt temp 2500 2500 0.1 iso 0.0 0.0 10.0 #run 100000 every 1 "set type 2*3 vx 0.0 vy 0.0 vz 0.0" #unfix 1 write_data 043 |
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