应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/1返回列表
查看: 1214  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我是考研狗

新虫 (小有名气)

[交流] amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢

大家好，请教大家一个关于对酶蛋白进行动力学模拟的问题，amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢，虽然是参考了野生型的侧链位置，但是突变体的没有晶体结构（只突变了催化口袋内2-3个关键氨基酸），模拟的结果不稳定，前10ns挺稳定的，但是再续跑30ns时，辅因子位置变化会很大，或者底物位置变化会很大，有没有好的方法啊，谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2019-11-14 14:09:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl941

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:10
本帖内容被屏蔽
6楼2020-01-02 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl994

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:18
本帖内容被屏蔽
7楼2020-01-03 11:13:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl926

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:23
本帖内容被屏蔽
8楼2020-01-04 14:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl978

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:29
本帖内容被屏蔽
9楼2020-01-07 11:17:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl966

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:36
本帖内容被屏蔽
10楼2020-01-09 11:09:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冷血孤峰

银虫 (小有名气)
请问楼主，问题解决了吗

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
11楼2020-05-19 08:52:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xiaoqiuqiu202楼
2019-11-14 15:16   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing3楼
2019-11-15 16:32   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2019-11-18 21:49   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
psylhh5楼
2019-11-21 00:21   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 我是考研狗 的主题更新
111/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 生物学学硕求调剂：351分一志愿南京师范大学生物学专业 +6 …～、王…～ 2026-04-06 7/350 2026-04-06 18:54 by macy2011
[考研] 287分求调剂 有专利国奖一志愿哈工大085406 +3 白易辰 2026-04-06 4/200 2026-04-06 15:24 by going home
[考研] 085600，321分求调剂 +13 大馋小子 2026-04-04 14/700 2026-04-06 12:47 by barlinike
[考研] 一志愿南航，数一英一学硕317求调剂！！ +6 Acaciad 2026-04-04 6/300 2026-04-06 12:13 by 考研学校招点人
[考研] 生物学求调剂 +5 15064154688 2026-04-03 5/250 2026-04-06 11:56 by lijunpoly
[考研] 求调剂，一志愿郑州大学材料与化工专硕，英二数二342分，求老师收留 +19 v12abo 2026-04-02 21/1050 2026-04-06 09:29 by 蓝云思雨
[考研] 283求调剂 +5 baiiyu 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:35 by 啵啵啵0119
[考研] 081700学硕，323分，一志愿中国海洋大学求调剂学校 +16 披星河 2026-04-04 16/800 2026-04-05 11:27 by 猪会飞
[考研] 考研调剂 +11 小sun要好运 2026-04-04 11/550 2026-04-05 08:02 by qlm5820
[考研] 266分，一志愿电气工程，本科材料，求材料专业调剂 +11 哇呼哼呼哼 2026-04-01 12/600 2026-04-04 23:17 by 永字号
[考研] 材料调剂 +18 一样YWY 2026-04-02 19/950 2026-04-04 22:14 by hemengdong
[考研] 277求调剂 +4 12A3 2026-04-02 5/250 2026-04-04 20:28 by 蓝云思雨
[考研] 。 +5 雾与海 2026-04-02 6/300 2026-04-04 19:53 by 蓝云思雨
[考研] 321求调剂 +6 认真求上学 2026-04-03 6/300 2026-04-04 19:51 by dongzh2009
[考研] 350一志愿北京航空航天大学08500材料科学与工程求调剂 +5 kjnasfss 2026-04-03 5/250 2026-04-03 22:29 by 无际的草原
[考研] 338求调剂 +4 zzz，，r 2026-04-03 4/200 2026-04-03 16:39 by lijunpoly
[考研] 0805求调剂 +8 是水分 2026-03-31 8/400 2026-04-02 10:46 by guanxin1001
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +8 cs0106 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:36 by 不吃魚的貓
[考研] 354求调剂 +4 lxb598 2026-03-31 5/250 2026-04-02 09:55 by Jaylen.
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭