应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢
111/1返回列表
查看: 1204  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

我是考研狗

新虫 (小有名气)

[交流] amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢

大家好，请教大家一个关于对酶蛋白进行动力学模拟的问题，amber动力学模拟时，怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢，虽然是参考了野生型的侧链位置，但是突变体的没有晶体结构（只突变了催化口袋内2-3个关键氨基酸），模拟的结果不稳定，前10ns挺稳定的，但是再续跑30ns时，辅因子位置变化会很大，或者底物位置变化会很大，有没有好的方法啊，谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2019-11-14 14:09:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl941

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:10
本帖内容被屏蔽
6楼2020-01-02 09:45:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl994

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:18
本帖内容被屏蔽
7楼2020-01-03 11:13:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl926

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:23
本帖内容被屏蔽
8楼2020-01-04 14:59:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl978

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:29
本帖内容被屏蔽
9楼2020-01-07 11:17:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pl966

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币-200, 屏蔽内容 2020-01-09 21:38:36
本帖内容被屏蔽
10楼2020-01-09 11:09:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冷血孤峰

银虫 (小有名气)
请问楼主，问题解决了吗

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
11楼2020-05-19 08:52:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
xiaoqiuqiu202楼
2019-11-14 15:16   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
miaojiabing3楼
2019-11-15 16:32   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
tzynew4楼
2019-11-18 21:49   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
psylhh5楼
2019-11-21 00:21   回复  
我是考研狗(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 我是考研狗 的主题更新
111/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +5 d如愿上岸 2026-03-12 8/400 2026-03-16 15:19 by peike
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +7 超级伊昂大王 2026-03-10 7/350 2026-03-14 00:49 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +3 李新光 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:21 by JourneyLucky
[考研] 2026考研调剂+本科延边大学+山东大学+生物化学与分子生物学+有项目经验 +3 ccdsscjy 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:12 by JourneyLucky
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 求b区学校调剂 +3 周56 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:20 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +7 18880831720 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:10 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。，。，。，。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 26考研求调剂 +5 丶宏Sir 2026-03-13 5/250 2026-03-13 13:05 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭