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amber动力学模拟时,怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢
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| 大家好,请教大家一个关于对酶蛋白进行动力学模拟的问题,amber动力学模拟时,怎么让底物周围氨基酸的侧链位置更准确呢,虽然是参考了野生型的侧链位置,但是突变体的没有晶体结构(只突变了催化口袋内2-3个关键氨基酸),模拟的结果不稳定,前10ns挺稳定的,但是再续跑30ns时,辅因子位置变化会很大,或者底物位置变化会很大,有没有好的方法啊,谢谢。 |
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6楼2020-01-02 09:45:43
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7楼2020-01-03 11:13:28
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8楼2020-01-04 14:59:03
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9楼2020-01-07 11:17:31
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10楼2020-01-09 11:09:38
11楼2020-05-19 08:52:33
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2019-11-14 15:16
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