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ymwaizc金虫 (正式写手)
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[求助]
含B元素化合物的MD模拟求助
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合成了一个含有B元素的化合物，找做MD的同学做模拟，告诉我没有B的力场参数，请教各位大佬，这种情况改如何解决呢？有没有什么好的建议呢，谢谢了 |
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yongleli
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 93 (初中生)
- 金币: 3769.1
- 散金: 369
- 红花: 24
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- 在线: 101.3小时
- 虫号: 303595
- 注册: 2006-12-03
- 专业: 原子和分子物理
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网上有免费的generalized Charmm力场生成器，查找Swiss Charmm parameter，还有免费的OPLS力场生成器。Amber Tools里有GAFF力场生成器（需要去ambermd.org学习使用方法）但要注意，上述三种方法生成的力场参数中，电荷是不靠谱的，最好用RESP拟合，重新生成电荷。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2022-07-27 12:15:08