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ymwaizc金虫 (正式写手)
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[求助]
含B元素化合物的MD模拟求助
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合成了一个含有B元素的化合物,找做MD的同学做模拟,告诉我没有B的力场参数,请教各位大佬,这种情况改如何解决呢?有没有什么好的建议呢,谢谢了 |
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yongleli
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 93 (初中生)
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- 红花: 24
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- 在线: 101.3小时
- 虫号: 303595
- 注册: 2006-12-03
- 专业: 原子和分子物理
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网上有免费的generalized Charmm力场生成器,查找Swiss Charmm parameter,还有免费的OPLS力场生成器。Amber Tools里有GAFF力场生成器(需要去ambermd.org学习使用方法)但要注意,上述三种方法生成的力场参数中,电荷是不靠谱的,最好用RESP拟合,重新生成电荷。 发自小木虫IOS客户端 |
2楼2022-07-27 12:15:08











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