| 查看: 1234 | 回复: 2 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者fengrui826将赠送您 20 个金币 | ||
fengrui826新虫 (小有名气)
|
[求助]
sander读取NetCDF格式rst文件失败
|
|
|
各位老师好！求助前辈们一个问题：我用amber18进行动力学模拟时，用sander做了能量最小化，然后用最小化的重开始文件(.rst)作为升温系统的输入文件，然后out文件报错："getting box info from netcdf restart file"。把.rst换用未能量最小化的inpcrd文件就可以正常运行命令，把.rst换成.nc，.rst7仍报错。请问这个问题是什么原因呢？ 我的min.in文件如下： &cntrl imin=1,maxcyc=2000,ncyc=1000, cut=10, ntx=1, ntpr=100, ntc=2,ntf=2, igb=2,saltcon=0.1, ntr=1, restraint_wt=0.5, restraintmask=':1-190', / 我的heat.in文件如下： &cntrl imin=0, ntx=1, irest=0, nstlim=2500, dt=0.002, ntc=2, ntf=2, ntt=3, gamma_ln=2.0, tempi=0.0, temp0=50.0, ntpr=500, ntwx=500, ntb=1, saltcon=0.1, / min计算得到的rst文件也能生成PDB文件，但是rst文件在作为升温的输入文件时总是过不去。求助前辈们，请问是什么原因呢？谢谢您能帮忙解答。 |
回复此楼» 猜你喜欢
河北省自然科学基金
已经有8人回复
-
西安交大新媒学院副院长用撤稿论文结题
已经有5人回复
-
论文撤稿了
已经有5人回复
-
某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路！
已经有5人回复
-
26/27申博自荐
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有7人回复
-
揭秘青基评审内幕：几个A才能顺利中标
已经有4人回复
-
青B发送上会通知了吗
已经有7人回复
-
博士申请
已经有3人回复
fengrui826
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 693.5
- 散金: 99
- 红花: 3
- 帖子: 198
- 在线: 69.9小时
- 虫号: 3743144
- 注册: 2015-03-16
- 专业: 植物化学保护
2楼2020-07-16 14:50:02
3楼2022-11-18 20:41:59
10