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fengrui826

新虫 (小有名气)

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专业: 植物化学保护

[求助] sander读取NetCDF格式rst文件失败

各位老师好！求助前辈们一个问题：我用amber18进行动力学模拟时，用sander做了能量最小化，然后用最小化的重开始文件(.rst)作为升温系统的输入文件，然后out文件报错："getting box info from netcdf restart file"。把.rst换用未能量最小化的inpcrd文件就可以正常运行命令，把.rst换成.nc，.rst7仍报错。请问这个问题是什么原因呢？
我的min.in文件如下：
&cntrl
imin=1,maxcyc=2000,ncyc=1000,
cut=10,
ntx=1,
ntpr=100,
ntc=2,ntf=2,
igb=2,saltcon=0.1,
ntr=1, restraint_wt=0.5, restraintmask=':1-190',
/
我的heat.in文件如下：
&cntrl
  imin=0, ntx=1, irest=0,
  nstlim=2500, dt=0.002,
  ntc=2, ntf=2,
  ntt=3, gamma_ln=2.0,
  tempi=0.0, temp0=50.0,
  ntpr=500, ntwx=500,
  ntb=1, saltcon=0.1,
/
min计算得到的rst文件也能生成PDB文件，但是rst文件在作为升温的输入文件时总是过不去。求助前辈们，请问是什么原因呢？谢谢您能帮忙解答。

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