| 查看: 902 | 回复: 0 | |||
stevenkkk木虫 (小有名气)
|
[求助]
Gaussian与Gromacs联用
|
|
求助： 有点小分子需要用Gaussian算，用pop=mk得出RESP电荷后，转为Gromacs跑动力学。这个小分子不是残基，也不是小配体，它是简单的一个有机小分子，用Gromacs来研究这个小分子的动力学，比如它与水的相互作用。该怎么实现呢？ 我在Gaussian计算得到小分子的log文件，用什么方法或软件，直接生产Gromacs的起始文件，来进行动力学模拟。 我计划用OPLS-AA/L，跑与水相互作用的动力学，该分子可以加热到100多度也没问题。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 gromacs |
» 猜你喜欢
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有26人回复
-
机械专硕325，寻找调剂院校
已经有4人回复
-
333求调剂
已经有7人回复
-
考研化学学硕调剂，一志愿985
已经有4人回复
-
0854控制工程 359求调剂 可跨专业
已经有9人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有9人回复
-
化学调剂0703
已经有8人回复
-
环境工程调剂
已经有6人回复
-
326求调剂
已经有7人回复
-
一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
[求助]QM/MM联用
已经有11人回复
- 用opengl做了个工程，编译无错误，但是运行不起来。。。
已经有11人回复
- 【求助】NAMD和VMD联用如何产生ligand的topology和parameter文件
已经有8人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
20