10楼: Originally posted by fangsteel at 2014-05-14 10:41:59
我觉得应该已经不是力场合适不合适的问题了，你看一下你的log文件的能量有没有奇奇怪怪的地方或者符号，还有看你最后的一个confout。gro构型，分子之间的间距是不是挺大的？...

11楼: Originally posted by xwwjd at 2014-05-14 19:58:24
确实，初始结构分子间距离是3.4 A，mdrun后是25 A左右，md.log文件没发现什么异常的地方呀！...

3楼: Originally posted by xwwjd at 2014-05-08 08:32:21
我按着格式修改后，mdrun后体系膨胀了，用的是npt系综，密度只有5.4kg/m3，而环己烷的是密度是779呢？问题出在哪里呢？求指教 ~~~~(>_<~~~~

;Name       nrexcl
CYLH        3


; nr   at type r ...