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小兵ai石头

铜虫 (初入文坛)

[求助] 多个.pmf文件怎么整合

我参照“http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/freenergy-index.html”的“A Tutorial on Adaptive Biasing Force Calculations in NAMD”教程用NAMD作ABF模拟。
在模拟过程中,几次意外中断,restart了好几次,得到一系列的.pmf文件。

我的问题是:
1、我的restart文件中只修改了firsttimestep、set inputname、set outputname,这样操作正确吗?
     在下边这个论坛中提到的“ABF inFiles”以及其中提到的“SET”又是什么,在哪里设置?跟我这个有关系吗?
     http://www.ks.uiuc.edu/Research/ ... st/namd-l/6065.html
2、怎么将这多个pmf文件整合为一个pmf文件,以用于作图。

希望知道的虫友能不吝指教~~
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小兵ai石头

铜虫 (初入文坛)

是我没有问清楚me?有做ABF模拟的给我指导一下吧~~我现在一片茫然啊o(╯□╰)o
2楼2014-06-06 21:07:36
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ruthxu

金虫 (正式写手)

楼主这个问题解决吗?是怎么解决的呢?我也遇到这个问题,不知道该怎么处理
Betterlatethannever!
3楼2014-08-21 21:04:27
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