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ansrang

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[交流] 【求助】demo运行不了？已有7人参与

ubuntu 下按照网上教程:
The GROMACS demoThe demo is designed to demonstrate the user-friendlynessof the GROMACS software package. The only non-friendly part isthat it requires the C shell to run the script. If your shellis e.g. bash (common on Linux), first start the C shell with thecommand 'tcsh'. To run the demo, first moveto your tutor/gmxdemo directory:

cd tutor/gmxdemo

And then start the demo script:

demo

This demo handles a complete Molecular Dynamics simulation of apeptide in water, starting from a pdbstructure. You will be asked to press return a few times, and to run the trajectory viewer. Please read the instructions as you go along.

出来提示:
No command 'demo' found, did you mean:
Command 'delo' from package 'delo' (universe)
Command 'idemo' from package 'ivtools-bin' (universe)
demo: command not found
请问这是怎么回事?

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1楼 2010-05-03 21:15:04

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sophia_999

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lei0736(金币+2):谢谢 2010-06-29 11:05:51

“必须将Gromacs安装路径的bin文件夹加入到系统PATH变量中。如果不加入PATH变量，那么运行时要加入命令的绝对路径”

我不知道怎么加到PATH变量中，运行时用绝对路径就可以了。比如文件在/usr/gromacs/tutor/gmxdemo里，运行时就输入/usr/gromacs/tutor/gmxdemo/demo

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2楼2010-06-29 11:01:18

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sophia_999

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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-29 19:58:10

不过我试完发现没有结果文件，比如trj，gro。

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3楼2010-06-29 11:10:48

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sikasun

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ghcacj(金币+1):谢谢 2010-07-29 19:58:00

引用回帖:

Originally posted by ansrang at 2010-05-03 21:15:04:
ubuntu 下按照网上教程:
The GROMACS demoThe demo is designed to demonstrate the user-friendlynessof the GROMACS software package. The only non-friendly part isthat it requires the C shell to run th ...

运行的时候是./demo
不是直接写demo

demo我倒是运行了，可是一路到最后时ngmx命令没有找到

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4楼2010-07-29 19:19:57

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