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dxl20132009铜虫 (小有名气)
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[求助]
用amber做DNA分子模拟
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在生成prmtop和inpcrd文件的时候出现下面的错误，请求大侠的帮助？我该怎么修改？ > saveamberparm comp DNA_2pc_h.prmtop DNA_2pc_h.inpcrd Checking Unit. WARNING: The unperturbed charge of the unit: -34.000000 is not zero. FATAL: Atom .R<DA5 1>.A<P 31> does not have a type. FATAL: Atom .R<DA5 1>.A<OP1 32> does not have a type. FATAL: Atom .R<DA5 1>.A<OP2 33> does not have a type. FATAL: Atom .R<DA5 19>.A<P 31> does not have a type. FATAL: Atom .R<DA5 19>.A<OP1 32> does not have a type. FATAL: Atom .R<DA5 19>.A<OP2 33> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 37>.A<C 1> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 37>.A<N 2> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 37>.A<O 3> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 38>.A<C 1> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 38>.A<N 2> does not have a type. FATAL: Atom .R<PC 38>.A<O 3> does not have a type. Failed to generate parameters Parameter file was not saved. |
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