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跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容,为什么?
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RT,小弟用GMX跑ligand和蛋白的体系1ns,在各种优化平衡之后,输入 grompp -f md.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -n index.ndx -o md_0_1.tpr mdrun -deffnm md_0_1 命令行运行数小时后,出来的md_0_1.trr文件大小为0,没有载入任何数据,为什么呢?之前平衡压力和温度的.trr文件里倒是写入了数据也观察到了模拟。 盼高手解答,谢谢! |
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