应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】关于RMSD的计算
51/1返回列表
查看: 2637  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

copyymk

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于RMSD的计算

想做两个蛋白之间的偏差值，恳请高手指教，最好是能得出Excel的比较图（如下）



[ Last edited by copyymk on 2011-1-14 at 14:52 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-01-12 16:23:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyj8119

木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by copyymk at 2011-01-12 16:23:03:
想做两个蛋白之间的偏差值，恳请高手指教，最好是能得出Excel的比较图（如下）

你用VMD算过吗？应该怎么选择？
赞一下 回复此楼
2楼2011-01-12 23:18:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wally8962

木虫 (著名写手)
★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2011-01-14 14:49:58
measure rmsd $sel $sel0

这个是计算rmsd的基本命令，自己编程处理dcd，更有助于理解。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-01-13 19:25:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

copyymk

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zyj8119 at 2011-01-12 23:18:43:

你用VMD算过吗？应该怎么选择？

听说gromacs可以做，但是不懂用
赞一下 回复此楼
4楼2011-01-14 14:59:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yin_yin

银虫 (小有名气)
★
zh1987hs(金币+1): 谢谢 2011-01-16 20:54:22
这个图是动力学模拟轨迹的rmsd图。你要两个蛋白之间的偏差值，只有一个值，怎么作图，不明白
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-01-15 18:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 copyymk 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭