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haiyanqian

木虫 (小有名气)

[求助] 关于amber动力学模拟中MM/GBSA的问题

在用amber软件中,进行结合自由能计算与能量分解用MM-PBSA/GBSA方法,为了更深入地表示蛋白和氨基酸残基的相互作用,一般文献中会用相互作用能量和氨基酸残基数的一个关系图表示,我想问一下那个图是怎么作出来的~非常感谢!!!
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sfwere

至尊木虫 (职业作家)

楼主是镁铝 打包票 嗯嗯
最是寂寞心
2楼2012-02-15 15:42:23
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ferlich

禁虫 (小有名气)


chaizhm(金币+2): 2012-02-23 08:55:26
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3楼2012-02-22 17:04:49
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sfwere

至尊木虫 (职业作家)

楼主是想问怎么出图的吧
最是寂寞心
4楼2012-02-22 17:41:43
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haiyanqian

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by ferlich at 2012-02-22 17:04:49:
mm/pbsa里面可以做能量分解啊,可以把每个残基对结合能的贡献算出来。自带的例子里面有

恩,我也看了,试了一下用Origin软件是可以出图的,谢谢你呦~
5楼2012-02-22 17:42:07
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haiyanqian

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by sfwere at 2012-02-22 17:41:43:
楼主是想问怎么出图的吧

是的呀,你知道呢?
6楼2012-02-22 17:43:02
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轻轻的风

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
chaizhm(金币+1): 2012-02-23 08:55:40
origin 可以, 你可以试试
我以前做过~
7楼2012-02-22 23:00:46
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haiyanqian

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
我主要是现在前面还没有跑平,恒温过程做出来的RMSd图一直是上升的,您有遇到过这个问题呢?
8楼2012-02-23 11:00:54
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