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使用amber力场,一些参数无法获得
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jane8556
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使用amber力场,一些参数无法获得
有机物分子采用amber力场,有机分子按照amber的原子类型分类定义了原子类型,但是有些键,角及二面角还有非正常二面角的参数无法查到,请问怎么办呢,采用近似的方法,还是可以使用antechamber生成这些参数,谢谢!
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2013-07-17 15:48:54
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dubo
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★
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2013-07-18 16:18:03
如果其他的力场里有你所需粒子的力场参数,你可以用杂化力场做模拟
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jane8556
2楼
2013-07-17 19:56:56
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2楼
:
Originally posted by
dubo
at 2013-07-17 19:56:56
如果其他的力场里有你所需粒子的力场参数,你可以用杂化力场做模拟
cvff力场里面有相应的参数,请问可以用吗?
请问杂化力场的意思就是两种参数混合着用吗?
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3楼
2013-07-17 22:33:08
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★ ★ ★ ★ ★
jane8556: 金币+5
2013-07-19 20:23:01
嗯,可以的
以前有人这么做过
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4楼
2013-07-18 10:26:39
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jane8556
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4楼
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Originally posted by
dubo
at 2013-07-18 10:26:39
嗯,可以的
以前有人这么做过
谢谢,我试试
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2013-07-18 10:29:00
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应该可以使用antechamber可以生成需要的力场文件和拓扑文件参数吧,你要不用acdoctor来检查下,看能不能把参数补齐
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6楼
2014-10-21 21:02:13
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