| ²é¿´: 2287 | »Ø¸´: 4 | ||
³¬ÈËÓëСľ³æ½ð³æ (СÓÐÃûÆø)
|
[ÇóÖú]
ATP·Ö×ÓÁ¦³¡²ÎÊýÔõô×ö
|
| ´ó¼ÒºÃ£¡ÇëÎÊÓÐûÓÐATPÁ¦³¡²ÎÊý×ö³É¹¦µÄ£¿ÓõÄÊÇAmber antechamber³ÌÐò£¬ATPÊÇÅäÌ壬±£´æ³ÉPDB¸ñʽÎļþ£¬µ«ÓÃAM1 bccËã²»ÁË£¬ÓоÑéµÄ´óÏÀÄÜ·ñ¸øµã½¨Ò飿лл£¡Áí£ºÔÚPDBÊý¾Ý¿âÀïÏÂÔØµÄµ°°×£¬Æä¾§Ìå½á¹¹ÖмäȱʧÁ˼¸¸ö°±»ùËᣬӰÏìÅܶ¯Á¦Ñ§Â𣿠|
» ²ÂÄãϲ»¶
3-äåßÁà¤-4-¼×È©ºÏ³É
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ19È˻ظ´
²ÄÁÏר˶322
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
Ò»Ö¾Ô¸ÄϾ©º½¿Õº½Ìì´óѧ ²ÄÁÏÓ뻯¹¤329·ÖÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
285Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
²ÄÁÏÇóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ11È˻ظ´
µ÷¼Á
ÒѾÓÐ8È˻ظ´
²ÄÁϵ÷¼Á
ÒѾÓÐ14È˻ظ´
²ÄÁÏ334Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ17È˻ظ´
332Çóµ÷¼Á
ÒѾÓÐ16È˻ظ´
» ±¾Ö÷ÌâÏà¹ØÉ̼ÒÍÆ¼ö: (ÎÒÒ²ÒªÔÚÕâÀïÍÆ¹ã)
» ±¾Ö÷ÌâÏà¹Ø¼ÛÖµÌùÍÆ¼ö£¬¶ÔÄúͬÑùÓаïÖú:
tinkerʹÓÃoplsaaÁ¦³¡µÄÔ×ÓÀàÐͶ¨ÒåÎÊÌâ
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
ÐÂÊÖÇë½ÌamberÁ¦³¡ÎÊÌâ
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
ÓÃamberÖÆ×÷С·Ö×ÓÁ¦³¡²ÎÊýʱͻȻÓöµ½µÄһЩÎÊÌâ
ÒѾÓÐ12È˻ظ´
ÈçºÎÔÚdiamondÖÐÌí¼ÓÇâ¼ü
ÒѾÓÐ8È˻ظ´
¾µä·Ö×Ó¶¯Á¦Ñ§Á¦³¡¡¢Êƺ¯Êý
ÒѾÓÐ9È˻ظ´
¼±Çó½â´ð£¬¹ØÓÚÁ¦³¡µÄµçºÉ²ÎÊý£¡£¡£¡
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
¹ØÓÚMSÁ¦³¡±à¼
ÒѾÓÐ11È˻ظ´
ÈçºÎÀûÓÃGULPÄâºÏ·Ö×Ó¼äÊÆÄÜÇúÏߵóöÁ¦³¡²ÎÊý
ÒѾÓÐ10È˻ظ´
ʹÓÃamberÁ¦³¡£¬Ò»Ð©²ÎÊýÎÞ·¨»ñµÃ
ÒѾÓÐ5È˻ظ´
MSÖÐsorptionÄ£¿éʹÓÃ×Ô¶¨ÒåÁ¦³¡³öÏÖµÄÎÊÌâ
ÒѾÓÐ26È˻ظ´
·Ö×Ó¶¯Á¦Ñ§Ä£ÄâÁ¦³¡
ÒѾÓÐ13È˻ظ´
ÇëÎÊÓÐûÓÐС·Ö×ÓÊý¾Ý¿â¿ÉÒÔÖ±½ÓÏÂÔØÏà¹ØµÄÁ¦³¡²ÎÊýÎļþµÄ£¿
ÒѾÓÐ3È˻ظ´
ÇóÖúË®·Ö×ӵĴÖÁ£»¯Á¦³¡²ÎÊý£¬3¸ö4¸öË®·Ö×ӵͼÐÐ
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
ÇëÎÊATPÈçºÎ±£´æ
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
LAMMPSÖÐReaxFFÁ¦³¡ÊÇÔõô»ØÊ£¿
ÒѾÓÐ17È˻ظ´
Ôõô×Ô¼º×öÁ¦³¡-¼°ÆøÌåÁ¦³¡µÄÑ¡Ôñ
ÒѾÓÐ6È˻ظ´
ÇóGromacsÖÐGlycamÁ¦³¡Êý¾Ý°ü¡£¡£·Ç³£¸Ðл
ÒѾÓÐ5È˻ظ´
ÈçºÎ»ñÈ¡Á¦³¡²ÎÊýÎļþ£¿
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
ÓÃtinkerµÄamoeba09Á¦³¡Ä£Äâ~~×ÜÊÇÌáʾ²ÎÊý䶨Òå~~~Ôõô°ì°¡~ÈÈÇÐÇóÖú
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
¡¾×ªÌû¡¿ÓÃAmber+Gaussian×öС·Ö×ÓÁ¦³¡
ÒѾÓÐ16È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿ÇëÎÊÈçºÎÏÂÔØOPLS-AAÁ¦³¡
ÒѾÓÐ7È˻ظ´
¡¾ÇóÖú¡¿ÔÚNAMDÔËÐÐÖÐʹÓÃCHARMM¸ñʽµÄÁ¦³¡Îļþ£¬µ«Á¦³¡²ÎÊýÀ´×ÔAMBERÁ¦³¡£¬»á³öÎÊÌâÂ
ÒѾÓÐ4È˻ظ´
¡¾ÌÖÂÛ¡¿·Ö×ÓÄ£ÄâÖÐÁ¦³¡²ÎÊýµÄµ÷½ÚÌÖÂÛ
ÒѾÓÐ7È˻ظ´

³¬ÈËÓëСľ³æ
½ð³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 1 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 897.9
- ºì»¨: 2
- Ìû×Ó: 300
- ÔÚÏß: 151.5Сʱ
- ³æºÅ: 1101501
- ×¢²á: 2010-09-17
- ÐÔ±ð: GG
- רҵ: ÉúÎï´ó·Ö×ӽṹÓ빦ÄÜ

2Â¥2012-03-09 16:12:21
lovedi
Òø³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 1 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 25.5
- É¢½ð: 67
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 231
- ÔÚÏß: 135.8Сʱ
- ³æºÅ: 1094850
- ×¢²á: 2010-09-10
- ÐÔ±ð: MM
- רҵ: ÉúÎïÐÅϢѧ
3Â¥2012-03-10 05:12:23
lovedi
Òø³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 1 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 25.5
- É¢½ð: 67
- ºì»¨: 3
- Ìû×Ó: 231
- ÔÚÏß: 135.8Сʱ
- ³æºÅ: 1094850
- ×¢²á: 2010-09-10
- ÐÔ±ð: MM
- רҵ: ÉúÎïÐÅϢѧ
¡ï
zh1987hs(½ð±Ò+1): лл 2012-03-10 23:15:51
zh1987hs(½ð±Ò+1): лл 2012-03-10 23:15:51
|
¿´antechamberµÄÏà¹Ø½Ì³Ì°É http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial4b/ |
4Â¥2012-03-10 18:33:23
³¬ÈËÓëСľ³æ
½ð³æ (СÓÐÃûÆø)
- Ó¦Öú: 1 (Ó×¶ùÔ°)
- ½ð±Ò: 897.9
- ºì»¨: 2
- Ìû×Ó: 300
- ÔÚÏß: 151.5Сʱ
- ³æºÅ: 1101501
- ×¢²á: 2010-09-17
- ÐÔ±ð: GG
- רҵ: ÉúÎï´ó·Ö×ӽṹÓ빦ÄÜ

5Â¥2012-03-10 19:57:43














»Ø¸´´ËÂ¥