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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » tinker使用oplsaa力场的原子类型定义问题
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jlsdyac

木虫 (正式写手)

[求助] tinker使用oplsaa力场的原子类型定义问题 已有1人参与

在amber力场中，三个氧、三个氟的原子类型编号可以一样啊

oplsaa力场中，CF3SO3中的三个氟和三个氧的原子编号和原子类型编号必须都不一样吗？
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1楼 2014-03-29 21:24:59
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zlf9452006

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-31 17:00:13
和amber一样，可以是一样的

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2楼2014-03-30 08:29:39
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jlsdyac

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zlf9452006 at 2014-03-30 08:29:39
和amber一样，可以是一样的

谢谢回复，但我设成一样的，tinker报错，如下
KANGLE  --  Too many Bond Angle Bending Parameters

请问是怎么回事？如何解决？
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3楼2014-03-30 10:12:37
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zlf9452006

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
jlsdyac: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-03-30 14:00:28
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 感谢指导！ 2014-03-31 17:00:34
引用回帖:
3楼: Originally posted by jlsdyac at 2014-03-30 10:12:37
谢谢回复，但我设成一样的，tinker报错，如下
KANGLE  --  Too many Bond Angle Bending Parameters

请问是怎么回事？如何解决？...

这个看样子是你的连接性搞错了

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2014-03-30 12:46:15
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jlsdyac

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zlf9452006 at 2014-03-30 12:46:15
这个看样子是你的连接性搞错了
...

您好，谢谢回复
我检查了xyz文件，连接没有错误。我又把一部分相同的原子的原子类型编号改成不同的，还是出现这个错误。。。

请问这是怎么回事？
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5楼2014-03-30 14:08:27
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