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amber跑蛋白复合物动力学前，小分子用高斯如何处理
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| 想练习下用amber跑蛋白小分子复合物的动力学过程，因为amber中没有小分子的参数信息，需要自己设置。请问用gaussian需要做哪些处理呢？ |
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 amber |
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wangyan10
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【答案】应助回帖
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倩430: 金币+3, ★有帮助 2012-12-06 23:05:42
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倩430: 金币+3, ★有帮助 2012-12-06 23:05:42
| 小分子的信息在AMBER力场中没有的，需要用amber自带的antechamber模块进行小分子力场的构建，如果不成功的话，就需要考虑用GAUSSIAN来进行构建小分子力场了。具体做法论坛上有，请参看这篇帖子http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3052985 |
2楼2012-10-09 09:04:51
3楼2012-10-09 10:42:08
wangyan10
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wangyan10
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