| 查看: 1445 | 回复: 4 | ||
小白如水铁杆木虫 (小有名气)
|
[求助]
Amber tools 中的antechamber 必须要在安装了amber11的前体下才能使用么?
|
我想得到乙烯在amber力场下的键和参数，看到有人说antechamber可以得到这些参数，自己下了antechamber发现不能用，原来antechamber是ambertools的一部分，要有ambertool才可以，我又去下了ambertools，安装好发现还是不能用，照着说明说第一步的reduce sustiva.pdb > sustiva_h.pdb 和antechamber antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 都找不到指令。难道必须有amber11才行么？amber11是收费的啊。。好郁闷 求大家帮忙。 或者谁帮我用antechamber算一下乙烯的amber力场参数，我有量化算好的乙烯的pdb文件。 不胜感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
焦虑
已经有8人回复
-
308求调剂
已经有4人回复
-
NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗
已经有14人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有6人回复
-
化学调剂0703
已经有7人回复
-
327求调剂
已经有11人回复
-
调剂
已经有8人回复
-
梁成伟老师课题组欢迎你的加入
已经有7人回复
-
伙伴们，祝我生日快乐吧
已经有24人回复
-
中科院材料273求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- amber中硅原子键参数如何获取？
已经有8人回复
- 如何在amber里面添加多个分子？
已经有7人回复
- amber10聚类cluster
已经有4人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
- 【求助】请教使用Ambertools处理ligand的问题
已经有6人回复
- 【求助】偶联反应的种类及反应机理【有效日期至2010年11月30日】
已经有4人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】AMBER11安装问题
已经有5人回复
- 有关Amberlyst 15的预处理（质子化）
已经有5人回复
shengxiang
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 805.5
- 散金: 2572
- 红花: 9
- 帖子: 1460
- 在线: 154.1小时
- 虫号: 800854
- 注册: 2009-06-29
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-01-08 08:38:48
fmtzhangli
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1311.3
- 红花: 1
- 帖子: 73
- 在线: 132.5小时
- 虫号: 908286
- 注册: 2009-11-20
- 专业: 生物信息学
3楼2012-01-08 18:19:58
小白如水
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6011.2
- 散金: 6
- 红花: 3
- 帖子: 232
- 在线: 61.8小时
- 虫号: 1049434
- 注册: 2010-06-29
- 专业: 分离过程
4楼2012-01-08 19:06:21
5楼2012-02-17 13:20:02
5