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小白如水铁杆木虫 (小有名气)
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Amber tools 中的antechamber 必须要在安装了amber11的前体下才能使用么?
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我想得到乙烯在amber力场下的键和参数，看到有人说antechamber可以得到这些参数，自己下了antechamber发现不能用，原来antechamber是ambertools的一部分，要有ambertool才可以，我又去下了ambertools，安装好发现还是不能用，照着说明说第一步的reduce sustiva.pdb > sustiva_h.pdb 和antechamber antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 都找不到指令。难道必须有amber11才行么？amber11是收费的啊。。好郁闷 求大家帮忙。 或者谁帮我用antechamber算一下乙烯的amber力场参数，我有量化算好的乙烯的pdb文件。 不胜感激！ |
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