| 查看: 1454 | 回复: 4 | ||
小白如水铁杆木虫 (小有名气)
|
[求助]
Amber tools 中的antechamber 必须要在安装了amber11的前体下才能使用么?
|
我想得到乙烯在amber力场下的键和参数，看到有人说antechamber可以得到这些参数，自己下了antechamber发现不能用，原来antechamber是ambertools的一部分，要有ambertool才可以，我又去下了ambertools，安装好发现还是不能用，照着说明说第一步的reduce sustiva.pdb > sustiva_h.pdb 和antechamber antechamber -i sustiva_new.pdb -fi pdb -o sustiva.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 都找不到指令。难道必须有amber11才行么？amber11是收费的啊。。好郁闷 求大家帮忙。 或者谁帮我用antechamber算一下乙烯的amber力场参数，我有量化算好的乙烯的pdb文件。 不胜感激！ |
回复此楼» 猜你喜欢
0856调剂，是学校就去
已经有9人回复
-
298-一志愿中国农业大学-求调剂
已经有9人回复
-
265求调剂
已经有7人回复
-
求调剂
已经有4人回复
-
学校已经提交到NSFC，还能修改吗？
已经有7人回复
-
材料学硕297已过四六级求调剂推荐
已经有6人回复
-
295复试调剂
已经有7人回复
-
本人考085602 化学工程 专硕
已经有20人回复
-
一志愿中南化学337求调剂
已经有5人回复
-
281求调剂（0805）
已经有23人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- amber中硅原子键参数如何获取？
已经有8人回复
- 如何在amber里面添加多个分子？
已经有7人回复
- amber10聚类cluster
已经有4人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
- 【求助】请教使用Ambertools处理ligand的问题
已经有6人回复
- 【求助】偶联反应的种类及反应机理【有效日期至2010年11月30日】
已经有4人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】AMBER11安装问题
已经有5人回复
- 有关Amberlyst 15的预处理（质子化）
已经有5人回复
shengxiang
木虫 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 805.5
- 散金: 2572
- 红花: 9
- 帖子: 1460
- 在线: 154.1小时
- 虫号: 800854
- 注册: 2009-06-29
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-01-08 08:38:48
fmtzhangli
金虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1311.3
- 红花: 1
- 帖子: 73
- 在线: 132.5小时
- 虫号: 908286
- 注册: 2009-11-20
- 专业: 生物信息学
3楼2012-01-08 18:19:58
小白如水
铁杆木虫 (小有名气)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 6011.2
- 散金: 6
- 红花: 3
- 帖子: 232
- 在线: 61.8小时
- 虫号: 1049434
- 注册: 2010-06-29
- 专业: 分离过程
4楼2012-01-08 19:06:21
5楼2012-02-17 13:20:02
