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helitrope

新虫 (小有名气)

[交流] oniom中配体分子的amber力场 已有1人参与

大家好，我有一个蛋白配体的复合物，我把蛋白的部分用amber力场算，配体部分用DFT方法算。可是运行的时候总是显示：MM function not complete。还显示许多键角参数没有找到。我是再G03运行的。
后来我在G09运行同样的体系，虽然也显示这些参数没有找到，G09忽略掉了这些参数，能够顺利运行下去。
请问各位，这种情况在G03下应该怎么办？
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helitrope

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1楼 2011-09-24 15:28:50
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voleyes

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
是不是原子类型不对
如果参数没有的话，需要自己输入参数，手册上有的
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2楼2011-09-25 14:27:52
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helitrope

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
恩，谢谢你
配体分子没有amber力场参数，请问怎样得到缺少的力场参数？
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3楼2011-09-25 18:34:23
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voleyes

银虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
可以在amber力场库里找一下吧，或者试试antechamber
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-09-25 23:37:59
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helitrope

新虫 (小有名气)
非常谢谢你
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5楼2011-09-26 08:41:58
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