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oniom中配体分子的amber力场
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helitrope
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专业: 理论和计算化学
[交流]
oniom中配体分子的amber力场
已有1人参与
大家好,我有一个蛋白配体的复合物,我把蛋白的部分用amber力场算,配体部分用DFT方法算。可是运行的时候总是显示:MM function not complete。还显示许多键角参数没有找到。我是再G03运行的。
后来我在G09运行同样的体系,虽然也显示这些参数没有找到,G09忽略掉了这些参数,能够顺利运行下去。
请问各位,这种情况在G03下应该怎么办?
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helitrope
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2011-09-24 15:28:50
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helitrope
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专业: 理论和计算化学
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恩,谢谢你
配体分子没有amber力场参数,请问怎样得到缺少的力场参数?
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3楼
2011-09-25 18:34:23
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voleyes
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专业: 理论和计算化学
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
是不是原子类型不对
如果参数没有的话,需要自己输入参数,手册上有的
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2楼
2011-09-25 14:27:52
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voleyes
银虫
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虫号: 947110
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
可以在amber力场库里找一下吧,或者试试antechamber
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4楼
2011-09-25 23:37:59
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