| 查看: 1850 | 回复: 6 | |||
[交流]
【求助】做MD时，溶剂盒子应该加多大算合适呢？ 已有6人参与
|
|
这个跟pdb分子的大小有关系吗？ 我看AMBER例子中加的是 solvatebox dna1 TIP3PBOX 8.0 也就是蛋白质分子到边界的距离为8埃， 如果我的体系很大的话，这个值是不是需要增加呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
299求调剂
已经有5人回复
-
收复试调剂生
已经有3人回复
-
280求调剂
已经有7人回复
-
环境领域全国重点实验室招收博士1-2名
已经有5人回复
-
303求调剂
已经有6人回复
-
290求调剂
已经有10人回复
-
0703化学求调剂 总分331
已经有3人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有8人回复
-
0703化学调剂
已经有3人回复
-
材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦
已经有9人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 化合物、是否与溶剂缔合
已经有16人回复
- 请问什么溶剂能够溶解固化后的酚醛树脂？
已经有20人回复
- 加溶剂后计算，不收敛，请高手指点
已经有5人回复
- 用DMSO做溶剂，后处理的时候加水稀释，加水量应该是DMSO的多少呢?
已经有5人回复
- 请教跑溶剂盒子(无大分子)哪个软件比较合适？
已经有3人回复
- 硼氢化钠还原羰基时，为何使用乙醇，甲醇，四氢呋喃做溶剂呢
已经有12人回复
- 如何获取力场参数文件？
已经有4人回复
- 用苯醚做溶剂应该用什么加热呢？（很高温度）
已经有14人回复
- 请教做MD计算时，蛋白质分子有一部分跑出水盒子
已经有9人回复
- 【求助】溶剂盒子的密度？
已经有5人回复
- 【求助】提取多糖时应不应该用乙醚丙酮等有机溶剂洗呢
已经有12人回复
- 【求助】利用挥发法培养单晶时，加的不良的溶剂加多少合适？
已经有6人回复
- 【求助结束】结构优化的时候如何提高力的收敛精度？
已经有10人回复
2楼2010-04-09 07:44:56
liuguan 
金虫 (著名写手)
计算蠕虫
- 应助: 161 (高中生)
- 贵宾: 0.125
- 金币: 1233.7
- 散金: 1414
- 红花: 5
- 帖子: 2503
- 在线: 547.2小时
- 虫号: 894492
- 注册: 2009-11-05
- 性别: GG
- 专业: 无机纳米化学
3楼2010-04-09 10:47:42
4楼2010-04-09 15:57:27
shenhua196
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 4.5
- 红花: 1
- 帖子: 3
- 在线: 1.1小时
- 虫号: 908029
- 注册: 2009-11-20
- 性别: MM
- 专业: 计算机辅助药物设计
5楼2010-04-11 10:36:30
tingjun
木虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3702.4
- 帖子: 173
- 在线: 38.8小时
- 虫号: 877690
- 注册: 2009-10-19
- 性别: MM
- 专业: 化学计量学与化学信息学
6楼2010-05-06 10:05:20
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-06 17:37:10
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-05-06 17:37:10
|
本帖内容被屏蔽 |
7楼2010-05-06 17:28:39
5