| 查看: 2084 | 回复: 5 | ||||||
| 本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看 | ||||||
[交流]
做分子的兄弟姐妹们平时常用的设计分析软件都有哪些呢？给新手指点一下吧O(∩_∩)O
|
||||||
因为相关的软件真的很多，想请教一下做分子的兄弟姐妹们平时常用的设计分析软件都有哪些呢？最好说一下优缺点和基本的作用，都来说说吧，交流一下O(∩_∩)O~~~给新手做些指点  |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 生物信息学软件应用 | 【分子生物】EPI帖 | 每天一点点 |
» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有268人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 蛋白电泳，第二向，溴酚蓝不是一条线，有两个向上的凸起，是什么原因造成的啊
已经有5人回复
- 急，帮看看细胞色素脱氢酶活性测定结果
已经有5人回复
- 萨特勒标准红外谱图（FT-IR）
已经有949人回复
- 聚丙烯的阻燃剂分解温度应该是多少？
已经有13人回复
- ATRP聚合中的大分子引发剂制备需不需要通氮气
已经有7人回复
- 如何定位酶与底物的作用位点
已经有6人回复
- 293TP细胞
已经有9人回复
- 细胞培养中的问题
已经有11人回复
- 一切都像手指间的沙子，不要太用力（转）
已经有19人回复
- 求问：解读NCBI 保守结构域分析结果
已经有11人回复
- 兄弟姐妹们,计算结晶度通用的方法-包括文献和计算方法！适用于高分子材料和无机材料！
已经有64人回复
- 【求助】请问咱学化学的最常用的画图软件有哪些，趁着这假期想抽空学习一下
已经有20人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
天津理工大学晶体镀膜实验室2026年硕士研究生调剂招生
+3/1398
-
中国科学院杭州医学研究所覃江江课题组招聘博士后
+1/1080
-
2026年山东科技大学低碳能源化工实验室招收化工工艺、环境工程硕士调剂信息
+1/181
-
江西科技师范大学 材料与能源招收调剂研究生
+1/92
-
2026年宁波工程学院招收硕士研究生（调剂）
+1/55
-
招收2026级公共卫生与预防医学专业（学硕）调剂生1名
+1/48
-
生物与医药专业硕士调剂（河北大学 化学与材料科学学院）
+2/28
-
三峡大学国家青年人才课题组招2026年化学/材料/化工类硕士调剂生
+1/20
-
武汉工程大学化学与环境工程学院2026年硕士研究生调剂公告
+1/17
-
招硕士研究生！招硕士研究生！招硕士研究生！招生专业：化学
+1/13
-
电力全国重点实验室双一流A类长江学者团队招2026年全日制博士1名（4月3日截止）
+1/10
-
欢迎加入我们的团队！招博士 半导体光电子器件与集成
+1/9
-
哈尔滨理工大学材料与化工学院刘刚老师团队招募“申请-考核”制博士
+1/8
-
【调剂上岸】985联合培养！1007/1055/08/07等，不限专业，想联培的速来！
+1/8
-
山东农业大学化学与材料科学学院 2026年硕士研究生拟接收调剂
+1/7
-
江西水利电力大学08工学接收调剂
+1/6
-
中国石油大学（北京）招收油藏数值模拟、油气人工智能、油田化学等相关方向博士后
+1/5
-
大连工业大学“轻工技术与工程”石海强教授课题组招收硕士研究生
+1/4
-
生物医学工程-生物医学信号处理方向博导求推荐
+1/4
-
五邑大学纺织科学与工程学院“智能纺织材料与纺织品”研究团队接收硕士调剂生
+1/3
天使托
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +57 - MolEPI: 106
- 应助: 95 (初中生)
- 贵宾: 0.263
- 金币: 16348.8
- 帖子: 3652
- 在线: 289小时
- 虫号: 441757
2楼2011-07-09 15:32:18
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+6, EPI+1): 真是够辛苦，不给都不行，有没有兴趣做个专家。帮助一下大家嘛 2011-07-09 18:16:19
西点6688(金币+3): 很有参考价值，谢谢参与！O(∩_∩)O 2011-07-11 10:17:54
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+6, EPI+1): 真是够辛苦，不给都不行，有没有兴趣做个专家。帮助一下大家嘛 2011-07-09 18:16:19
西点6688(金币+3): 很有参考价值，谢谢参与！O(∩_∩)O 2011-07-11 10:17:54
|
1，SAS，最新版本，9.2，超级大软件，10.5G：实验设计、数据分析、数据挖掘等功能强大。绝大多数期刊杂志都认可的数据分析软件，比我们常用的SPSS、Origin、Systat SigmaPlot强，支持编程。 最初接触这个软件是优化培养基配方，响应面方法中设计CCD、Box-Benhnken（BBD）实验，确实很强大。 2，Design Expert 8，个头很小，不到10M，实验设计简单易用。 3，正交设计助手II 3.1，专门做正交设计的。 4，DPS，国产软件，实验设计，数据分析，国内这方面的经典。 5，MatLab，这个，很牛的说,，生物信息学必备。 6，s-plus8：S 语言是由AT&T 贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析、作图的解释型语言。它的丰富的数据类型（向量、数组、列表、对象等）特别有利于实现新的统计算法，其交互式运行方式及强大的图形及交互图形功能使得我们可以方便的探索数据。 |
3楼2011-07-09 16:03:32
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+5): 这一楼支追加金币了，见谅了哦 2011-07-10 08:26:08
西点6688(金币+7): 正在学习，谢谢贡献~ 2011-12-01 17:54:44
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
dhd997(金币+5): 这一楼支追加金币了，见谅了哦 2011-07-10 08:26:08
西点6688(金币+7): 正在学习，谢谢贡献~ 2011-12-01 17:54:44
|
7，引物设计软件primer 5和oligo7，我觉得primer6并不是5的升级，引物设计还是推荐用primer5。设计好的引物，在primer里只有分数值指的称道，其他方面的评估不够，比如引物发卡结构，引物错配、二聚体等显示不够明晰，而oligo正好弥补了这个缺陷。PS：结合使用更好。 8，Vector NTI，从标题上来看，这个软件是做载体，或者说是构建质粒的，其实这是一个综合软件，包括引物设计、Invitrogen载体库、凝胶模拟、Assemble、Alignment等，还支持蛋白质PDB数据，观看修改3D蛋白。类似的软件有Gene Construction Kit、win plas、simvector、bvplasmid、Noeclone、clonemanager等。推荐Vector NTI。 9，凝胶图像处理软件：Bandscan5、QuantityOne、Totallab120、Gelpro、ImageJ、Bandleader等。个人推荐QuantiyOne和Gelpro，可以很方便的模拟计算出条带的分子量、计算条带百含量分比等数据。totallab也比较强悍，但是网络上鲜有破解版本，如果老板有金子，还是购买这个Totallab吧~ 10，DNAstar是一个综合软件，包含了7个模块：SeqBuilder - 可视化和序列编辑；SeqMan Pro - 序列集结和SNP发现；MegAlign - 序列组合；PrimerSelect - oligo primer 设计；Protean - 蛋白质结构分析和预测；GeneQuest - 基因查找；EditSeq - 导入特殊文件工具。我经常用到的是seqman，很不错的。现在版本已经更新到9。推荐。 11，BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括：序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等。 12，DNAsis MAX：综合性低级结构分析软件，包括DNA、RNA、蛋白质分析等，有兴趣的虫子可以研究一下。平时我都用来做蛋白质序列比对的。 13，Clustal和Mega5：多重序列比对软件，全免费，Mega5可以做比较漂亮的进化树。同类软件：GeneDoc。 14，DNAMAN 是美国 Lynnon Biosoft 公司开发的高度集成化的分子生物学综合应用软件，可以用于多序列比对、PCR 引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、蛋白质分析等，几乎囊括了所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。 15，discovery studio，DS。DS目前的主要功能包括：蛋白质的表征、同源建模、X-ray分析、基于结构药物设计工具（包括配体-蛋白质相互作用、全新药物设计和分子对接）。DS可以观看PDB蛋白质三维结构数据，同时能够提供大量相关信息，如酶的活性位点、配体等。同类软件：Lammps、Gromacs、Amber、Namd、Materials Studio、gaussian等。推荐：DS，搞分子模拟的除外。~,^ 还有好多很好用的软件，希望大家多多参与~ |
4楼2011-07-09 20:37:17
6楼2013-01-05 11:36:24
简单回复
2012-01-18 17:23
回复
西点6688: 金币+1 2012-04-28 16:10:24
支持
