| 查看: 2283 | 回复: 3 | ||
136zhangpong新虫 (小有名气)
|
[求助]
蛋白之间相互作用的残基及作用力 已有1人参与
|
| 我用DOT2作了两个相同小蛋白分子对接，用ACE截断值6，取了前200个构象，用Pymol看了，发现有一些明显的簇，现在我要分析各个明显优势结构中相互作用的残基，主要是由什么静态作用力（范德华力，氢键之类的）。这个应该从何入手；我也是作动力学模拟的，对接软件用的是DOT2,MD模拟用的是amber，现在才出对接结果，动力学模拟还没开始，导师让我先对对接结果作深入的研究，主要看看它们之间相互作用的残基和静态作用力。大家有什么好的方法，希望不吝赐教。 |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂
已经有7人回复
-
一志愿C9的化学工程（085602） 340分，感觉校内调剂无望，求调剂
已经有12人回复
-
312求调剂
已经有4人回复
-
材料专硕322
已经有9人回复
-
求调剂
已经有7人回复
-
085600材料与化工301分求调剂院校
已经有8人回复
-
一志愿 江南大学 085602 化工专硕 338分求调剂
已经有14人回复
-
070300化学学硕311分求调剂
已经有13人回复
-
材料调剂
已经有9人回复
-
一志愿河北工业大学材料工程，初试344求专硕调剂
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助：Gromacs平衡时蛋白跑出盒子了，怎么办？
已经有7人回复
- 蛋白和某基因是否有相互作用，有什么软件或者方法可以预测？
已经有4人回复
- 菜鸟求助。用gromacs的什么指令可以分析氢键能大小？
已经有6人回复
- 请问如何用amber进行π-π相互作用的分析
已经有7人回复
- 阴离子与氢键相互作用模拟
已经有3人回复
- 胞外蛋白质相互作用的方法
已经有17人回复
- 蛋白质同源模建求助！
已经有6人回复
- 高分子蛋白质之间相互作用，熵焓变问题。求深入讨论。
已经有7人回复
- gromacs主页的蛋白质与配体作用
已经有5人回复
- 急！待毕业！使用ELISA检测血清中抗体滴度，包被时的抗原可以不与载体蛋白偶联吗？
已经有14人回复
- 蛋白质相互作用预测
已经有9人回复
- 纳米材料合成中发生的反应或配体交换等
已经有7人回复
- 相互作用力能否用高斯计算证明
已经有6人回复
- 【求助】如何探究两个蛋白质之间的直接或间接相互作用？谢谢！
已经有6人回复
- 真核生物蛋白质相互作用预测软件
已经有8人回复
- 求助--两个蛋白之间的相互作用的试验方法
已经有4人回复
- 共聚水凝胶的结构和彼此之间的相互作用力的判断表征
已经有4人回复
- 【求助/交流】有没有软件或者网站可以预测蛋白质与DNA之间的相互作用？
已经有6人回复
- 【求助】荧光法研究相互作用力时怎样判断作用力类型？
已经有5人回复
- 【讨论】如何计算两分子间的有效相互作用力
已经有12人回复
2楼2014-03-17 19:09:19
136zhangpong
新虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 53.1
- 帖子: 93
- 在线: 28.2小时
- 虫号: 2745147
- 注册: 2013-10-19
- 专业: 计算数学与科学工程计算
3楼2014-03-18 11:36:56
★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-19 20:45:22
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2014-03-19 20:45:22
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2014-03-19 19:18:41
5