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gredream

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gredream

禁虫 (正式写手)

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2楼2008-11-29 17:51:54
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gredream

禁虫 (正式写手)

★ ★
灯塔守望者(金币+2):很有价值的讨论
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3楼2008-12-02 20:57:11
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★
灯塔守望者(金币+2):很有价值的讨论
这个题目在概念上有些不清楚的地方。
其实,如果说分子1整体和分子2整体的相互作用,那么这将是没完没了的一件事情。
因为,能够做的,是分子1的某个点与分子2的某个点的相互作用。
于是,问题来了:
分子1上的点,是什么意思?取点,取哪些点?那可以说是无穷多。
好了,就取分子1上的某个点吧,那么分子2上又可以取无穷多的点。
4楼2008-12-02 21:54:29
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gredream

禁虫 (正式写手)

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5楼2008-12-03 08:59:02
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

没做过,也不知道。
请问,点的概念是什么?分子中的点是什么意思?

如果是指原子或者原子核所在的位置,那就......
6楼2008-12-03 12:34:06
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gredream

禁虫 (正式写手)

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7楼2008-12-03 14:37:00
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

那么,点就是有限的若干个了。

MD把原子看成球,这就成了双刃剑。

改进:
借助简单的MO理论或者VB理论,电子云不是球形的喽!

因此,可以把每个原子“分解”成两个“点”(或者更多的点),
新点的位置呢,比原来的原子核位置(原子坐标)稍微离开一些。
新点还有自己的Partial Charge。

这样的体系,比经典的MD是不是更好捏?
8楼2008-12-03 18:06:06
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xuefei06

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by gredream at 2008-11-29 11:12:
m1-------m2

分子1,2,距离R,两分子都在水溶液里,当然还有其他相互作用势,比如电相互作用。

那么两者直接的有效相互作用力如何求?即分子1整体和分子2整体的相互作用?

有效相互作用,这个有效不是量 ...

MD计算相互作用,一般都是对相互作用,把两个分子上的原子对都遍历一遍,就可以求出两个分子间的相互作用力,也可以这个作用力当作分子几何中心或者质心受到力,这就是粗粒化的FM法的一个基本的思路。
9楼2008-12-03 19:25:47
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

粗就一个字......
10楼2008-12-03 21:39:17
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