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lifeisall

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于amber官网的第一个练习 已有1人参与

(是这样,我是自学Amber,所以大家先不要喷我问的问题简单,我的确需要帮助。)
amber官网上第一个Tutorial。网址:http://ambermd.org/tutorials/basic/tutorial1/
这里只讲了每一步是在干啥,可是怎么操作呢,他要算的DNA分子呢,我要算的文件在哪里找到啊?其实说白了,做这个作业,我怎么开始呢,我的目标文件在哪里?谢谢各位!
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[ Last edited by lifeisall on 2013-12-31 at 21:58 ]
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匿名

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月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-03 09:15:11
lifeisall(月只蓝代发): 金币+3, 感谢指导! 2014-05-31 20:33:52
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2楼2014-01-02 16:53:04
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lifeisall

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2014-01-02 16:53:04
你要先确保你安装了Amber,涉及到可视化软件VMD,也应该安装。操作系统是Linux。
所有的操作都在Linux终端以命令行的方式执行。DNA分子可以生成,如果不能生成,请先下载网站给出的分子,然后做后面的。

谢谢你!是这样的,我电脑上已经安装了amber11和vmd,我把amber11直接复制粘贴到了我们的服务器上,还用改什么环境变量什么的参数吗?我可以直接用吗?
3楼2014-01-02 18:23:26
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匿名

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lifeisall(月只蓝代发): 金币+2, 感谢指导! 2014-05-31 20:34:03
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4楼2014-01-02 19:08:01
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