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mojie1987

铜虫 (小有名气)

[求助] Amber的轨迹处理问题

额。。对蛋白质跑了4ns，然后进行了rmsd的分析，发现其中3ns之后体系趋于平衡。那么如何提取3ns之后的平均构型呢？
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1楼2013-05-02 16:36:47
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yyuan8658

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mojie1987: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-07 20:04:21
ben_ladeng: 金币+1, 谢谢交流 2013-05-07 20:36:28
trajin *.mdcrd 1001 4000
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2楼2013-05-02 20:30:15
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mojie1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2013-05-02 20:30:15
trajin *.mdcrd 1001 4000

额。。。因为我是分段跑的，先跑了2ns,又跑了2ns。。
这样的话肿么弄呢？O(∩_∩)O~~
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3楼2013-05-07 12:05:00
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mojie1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yyuan8658 at 2013-05-02 20:30:15
trajin *.mdcrd 1001 4000

哈。。搞定啦。。。O(∩_∩)O~直接用average就好啦。。。
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4楼2013-05-07 20:04:13
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