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viger87木虫 (正式写手)
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amber11+openmpi多节点并行计算速度变慢
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计算平台：6台台式电脑，各2个cpu,用openmpi并行 12cpu并行命令为：mpirun -np 12 -machinefile ** -prefix ** --mca pls_rsh_agent rsh --mca btl self,tcp sander.MPI -O -i ****** 运行命令后，每台机器上都有两个sander.MPI进程，且cpu使用都是100%左右 测试结果如下： 情况 估计剩余时间 6台共12cpu并行（sander.MPI）--------------- 300hours 1台共2cpu并行（sander.MPI） --------------- 11hours 1台共2cpu并行（sander） --------------- 20hours 1台共1cpu并行（sanderI） --------------- 20hours 问题：为什么12cpu反而计算速度变慢了，12cpu一直使用率都是100%左右，如果不是在计算我所提交的作业，那都在计算什么？设置有问题还是并行通信的问题？ 望各位不吝赐教 [ Last edited by viger87 on 2012-5-12 at 22:32 ] |
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viger87
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