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viger87木虫 (正式写手)
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amber11+openmpi多节点并行计算速度变慢
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计算平台:6台台式电脑,各2个cpu,用openmpi并行 12cpu并行命令为:mpirun -np 12 -machinefile ** -prefix ** --mca pls_rsh_agent rsh --mca btl self,tcp sander.MPI -O -i ****** 运行命令后,每台机器上都有两个sander.MPI进程,且cpu使用都是100%左右 测试结果如下: 情况 估计剩余时间 6台共12cpu并行(sander.MPI)--------------- 300hours 1台共2cpu并行(sander.MPI) --------------- 11hours 1台共2cpu并行(sander) --------------- 20hours 1台共1cpu并行(sanderI) --------------- 20hours 问题:为什么12cpu反而计算速度变慢了,12cpu一直使用率都是100%左右,如果不是在计算我所提交的作业,那都在计算什么?设置有问题还是并行通信的问题? 望各位不吝赐教 [ Last edited by viger87 on 2012-5-12 at 22:32 ] |
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viger87
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