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夏天的鱼

木虫 (小有名气)

[交流] RMSD,RMSF和RMSDF是如何理解的

一直不太明白轨迹的RMSF的计算是怎么实现的,amber的手册中提到的是
rms frist out  **.rmsd @* time 0.2
atomicfluct out **rmsf.out @* byres bfactor
而将轨迹导入VMD脚本分析,得到的RMSDF又是什么呢?
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科研就是讨论出来的
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smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
夏天的鱼: 金币+5 2014-07-24 12:46:36
本帖内容被屏蔽

2楼2014-07-24 12:20:04
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夏天的鱼

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-07-24 12:20:04
atomicfluct  用来算rmsf 或bfactor

那RMSDF又是什么呢
科研就是讨论出来的
3楼2014-07-24 12:46:17
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smutao

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2014-07-24 12:49:37
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