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qiqiaofang

金虫 (小有名气)

[求助] 如何用gromacs算蛋白质内部残基之间的疏水相互作用

本人正在用GROMACA算一个小蛋白的稳定性  蛋白中没有带负电的氨基酸 这也就排除了盐键的作用 那么稳定蛋白的因素也就只剩下氢键个疏水作用  但是我不知道如何用GROMACS来算和表征蛋白质内部残基之间(不含配体)的疏水作用请  而且这个蛋白中疏水残基的数目还挺多  恳求各位大神指点迷津!万分感谢
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