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[热点] 博士延得我，科研能力直往上蹿 偏振片 2026-02-04 刚刚
[Gromacs ] [已完结]请教gromacs蛋白与小分子相互作用分析    ( 1 2 ) (评阅+1) (12/4479) xueer小雯 2014-03-26 2016-03-08 14:27:14 by hsy123111
[Gromacs ] [已完结]gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了? (7/1537) wanglang1987 2012-10-10 2016-03-07 18:07:59 by 庚晨绮梦
[Gromacs ] [已完结]有关环糊精晶体结构的问题 (0/410) 红颜不美 2016-03-07 2016-03-07 16:09:09 by 红颜不美
[Gromacs ] 用NAMD跑一个蛋白和配体的动力学，怎么限制小分子呢    ( 1 2 ) (14/1593) qiulinqiong 2016-03-01 2016-03-04 09:40:05 by po390
[Gromacs ] [已完结]多原子分子力场文件怎么生成？ (3/1072) zzybjr 2015-12-11 2016-03-03 18:03:45 by zhouling1019
[Gromacs ] [已完结]配体分子的拓扑文件的制作    ( 1 2 ) (14/1948) yylcx 2015-08-28 2016-03-03 18:00:41 by zhouling1019
[Gromacs ] [已完结]用constraint force method如何计算PMF (评阅+1) (1/708) cjl_7955 2014-06-22 2016-02-24 16:55:05 by 程刚600
[Gromacs ] 【求助】关于VMD的安装 (3/756) astringent 2010-08-12 2016-02-24 16:04:48 by david6307
[Gromacs ] 【原创】在gromacs的gro中插入小分子    ( 1 2 ) (评阅+10) (模拟EPI+1)(12/3653) zyj8119 2010-12-14 2016-02-23 17:18:34 by cquwhy
[Gromacs ] [已完结]AMBER mm_pbsa.pl 无法提取构象 (1/1290) gezhenpeng 2013-04-18 2016-02-22 20:12:30 by Shirley_Shui
[Gromacs ] [已完结]集群跑NAMD (0/345) linhnux 2016-02-12 2016-02-12 17:08:04 by linhnux
[Gromacs ] [已完结]ptraj分析配体周围水分子个数与每帧（整个ＭＤ过程的动态变化）的关系 (6/975) keke_1210 2016-01-07 2016-01-29 19:21:59 by 老曼7
[Gromacs ] [已完结][关贴]Unable to add (duplicate?) residue U:6 (0/620) momo5694 2016-01-28 2016-01-28 21:11:35 by momo5694
[Gromacs ] [已完结][关贴]如何生成自组装单分子层的PSF文件， (0/425) momo5694 2016-01-26 2016-01-26 10:29:41 by momo5694
[Gromacs ] [已完结]有没有人用Gromacs+Plumed算过Targeted MD? (1/1462) 00陨石00 2016-01-24 2016-01-24 18:54:19 by 00陨石00
[Gromacs ] [已完结]gromacs，对水分子的处理，如果mdp同时定义了-DFLEXIBLE和constraints=h-bonds (0/1092) 吉米爱多 2016-01-22 2016-01-22 19:40:06 by 吉米爱多
[Gromacs ] [已完结]Gromacs能做金属氧化物纳米材料表面的蛋白质吸附的动力学模拟吗？ (2/790) huilovezhe 2016-01-21 2016-01-21 19:17:36 by huilovezhe
[Gromacs ] [已完结]超算中心并行版Gromacs的安装 (6/1698) 吉米爱多 2015-09-16 2016-01-21 16:23:26 by 赵红霞
[Gromacs ] [已完结]跪求Amber软件的MM-PBSA怎么进行能量分解？    ( 1 2 ) (15/2467) 背包旅客 2015-11-09 2016-01-20 20:49:56 by hdx1991
[Gromacs ] [已完结]gromacs无法生成gro文件 (5/2579) 牧雪长空 2013-01-21 2016-01-20 14:12:27 by 张德涛
[Gromacs ] [已完结]GROMACS跑完动力学后RDF分析和二面角随时间的变化 (0/1305) jws101 2016-01-20 2016-01-20 10:56:46 by jws101
[Gromacs ] [已完结]gromacs的mdp文件中，有一个periodic-molecules选项，选yes还是no？ (0/998) 吉米爱多 2016-01-17 2016-01-17 14:47:39 by 吉米爱多
[Gromacs ] [已完结]MMPBSA数据分析？IC50？ (0/980) yuilyamada 2016-01-15 2016-01-15 09:28:55 by yuilyamada
[Gromacs ] [已完结]自由能求解 (6/1696) youngfi 2013-08-28 2016-01-15 05:41:18 by youngfi
[Gromacs ] [已完结]editconf (2/897) 雨里看雪 2016-01-12 2016-01-13 15:27:31 by 雨里看雪
[Gromacs ] [已完结]NVT时出现here is no domain decomposition for 30 nodes (8/2144) jianchuanliu 2015-07-20 2016-01-13 07:54:17 by 余怀渺渺兮
[Gromacs ] [已完结]gro文件 (1/2021) zym765319199 2016-01-12 2016-01-12 16:51:37 by astrozheng
[Gromacs ] 用MS来构建模型，然后用Gromacs模拟，可行吗？ (评阅+1) (6/1169) wo335979123 2016-01-06 2016-01-10 21:13:31 by liji3b109
[Gromacs ] [已完结]PDB文件怎么下不到了 (6/1088) 有点坑 2015-12-30 2016-01-09 09:11:33 by pymol
[Gromacs ] 大家都用哪个版本的gromacs (4/1969) jinbei 2015-12-27 2016-01-09 06:40:38 by G、sir
[Gromacs ] [已完结]能量最小化跑不了 (1/1988) shabeir 2016-01-07 2016-01-09 06:34:42 by G、sir
[Gromacs ] [已完结]分子动力学模拟 (0/713) curicy 2016-01-08 2016-01-08 18:37:08 by curicy
[Gromacs ] [已完结]NAMD教程第一个例子，就是生成泛素的psf文件出问题 (评阅+1) (5/1372) 橙橙0916 2014-02-26 2016-01-08 17:29:28 by douwenhui
[Gromacs ] [已完结][关贴]新手求助——MMPBSA计算时出现错误，求指导 (0/586) 快乐柠檬草 2016-01-06 2016-01-06 14:55:54 by 快乐柠檬草
[Gromacs ] [已完结]gpu加速namd出错，All CUDA devices are in prohibited mode，谢谢 (1/440) patent 2016-01-03 2016-01-05 21:43:00 by patent
[Gromacs ] 【求助】加水后 碳纳米管不见了（已解决） (4/1563) ouczhouyi 2011-04-14 2016-01-02 20:52:01 by mileyfan
[Gromacs ] [已完结]gromacs溶剂化 (5/1106) 巫山忆 2015-12-28 2015-12-31 16:40:13 by 巫山忆
[Gromacs ] [已完结]Gromacs进行到能量最小化出现非法指令的提示，不知道是什么原因 (1/976) ynotshhhhh 2015-10-13 2015-12-29 13:39:40 by getengqing
[Gromacs ] [已完结]在Gromacs中怎样调节蛋白质和磷脂双分子层的相对位置？ (2/1041) zx66769185 2015-12-17 2015-12-28 16:45:40 by zx66769185
[Gromacs ] [已完结]gromacs如何实现一个结构的整体平动，而内部各原子之间距离保持不变？ (3/1120) 吉米爱多 2015-12-10 2015-12-27 16:23:26 by 吉米爱多
[Gromacs ] [已完结]用gromacs做金属酶（金属-β-内酰胺酶 NDM-1）时，活性中心的锌离子如何处理？ (评阅+1) (1/1275) lucyfly 2015-05-21 2015-12-26 13:32:08 by xmc克里斯
[Gromacs ] [已完结]模拟方法求助 (评阅+1) (3/556) 旭simulation 2014-07-03 2015-12-25 18:51:53 by yylcx
[Gromacs ] [已完结]利用amber14运行含金属的蛋白动力学时出现如下错误 (0/815) syd89522 2015-12-25 2015-12-25 16:25:33 by syd89522
[Gromacs ] [已完结]N-癸基吡啶四氟硼酸盐 (0/176) 雨里看雪 2015-12-23 2015-12-23 09:45:03 by 雨里看雪
[Gromacs ] [已完结]求助NPT压力耦合部分的设置问题 (3/1333) 吉米爱多 2015-12-15 2015-12-22 20:30:04 by 吉米爱多
[Gromacs ] Gromacs模拟油水体系，如何保证矿化度与实际相符 (32/1085) 玖月之殇 2015-07-06 2015-12-22 14:13:15 by zzybjr
[Gromacs ] [已完结]vmd中怎样逐帧显示配体周围3埃内的氨基酸 (1/1289) patent 2015-12-21 2015-12-22 10:20:59 by 我无语了123
[Gromacs ] [已完结]怎样关了vmd console窗口 (评阅+1) (3/1344) patent 2015-12-21 2015-12-22 10:11:58 by 我无语了123
[Gromacs ] [已完结]甲烷的pgn怎么写 (4/483) xslhd0808 2013-04-14 2015-12-22 06:51:59 by 赵红霞
[Gromacs ] NAMD中ABF计算自由能 (35/2054) 素君~~~ 2015-12-07 2015-12-21 18:03:59 by 我无语了123
[Gromacs ] [已完结]langevin dynamics (0/592) shabeir 2015-12-21 2015-12-21 04:55:46 by shabeir
[Gromacs ] [已完结]求助NAMD分子模拟接着再跑的CONF设置 (2/627) baicai734 2015-12-07 2015-12-19 16:56:28 by baicai734
[Gromacs ] [已完结]plumed 与namd patch问题 (1/1313) benniu2004 2014-08-21 2015-12-18 12:38:26 by 素君~~~
[Gromacs ] [已完结]请问谁分析过蠕虫状胶束，可否帮忙一下？ (1/360) 白玉浴血 2015-12-17 2015-12-17 20:49:10 by BBMC-2012
[Gromacs ] [已完结]FATAL ERROR: child atom 24 bonded only to child H atoms (0/403) yylcx 2015-12-17 2015-12-17 13:20:00 by yylcx
[Gromacs ] [已完结][关贴]top文件中func下的数字具体指哪个函数表达 (评阅+1) (1/390) chenai.com 2015-12-16 2015-12-16 09:26:29 by chenai.com
[Gromacs ] [已完结]建立菱形盒子 (4/1244) XYwinne 2015-09-15 2015-12-15 21:51:21 by XYwinne
[Gromacs ] [已完结]能量最小化 (2/1141) 雨里看雪 2015-12-01 2015-12-15 16:18:19 by zzybjr
[Gromacs ] [已完结]VMD建碳纳米管，readpdb命令读取失败 (评阅+1) (3/1151) 站立的树 2015-01-13 2015-12-15 13:21:51 by zzybjr
[Gromacs ] [已完结]请amber用户帮小弟转换一下pdb文件成为amber的top文件和crd文件 (3/1062) magicdalang 2015-12-10 2015-12-13 08:05:26 by smutao
[Gromacs ] [已完结]四苯基卟啉晶体结构在哪个晶体库中能下载？ (3/679) 红颜不美 2015-12-11 2015-12-12 11:10:24 by mgfudan
[Gromacs ] 【求助】NAMD安装问题    ( 1 2 ) (19/2406) 一步一步 2010-04-10 2015-12-08 13:31:03 by 6868DSL
[Gromacs ] [已完结][关贴]学习用Gromacs进行蛋白质的粗粒化的简单教程后，对于任意体系的粗粒化产生了诸多疑问 (0/963) zx66769185 2015-12-07 2015-12-07 20:05:44 by zx66769185
[Gromacs ] 【求助】请教怎么从trr文件中导出坐标【已解决】 (9/1544) yongma2008 2011-02-09 2015-12-07 07:01:01 by jikoukou
[Gromacs ] [已完结]gromacs 离子分析问题一例 (评阅+1) (2/512) 3115321 2014-06-16 2015-12-07 06:13:11 by jikoukou
[Gromacs ] [已完结]求助用namd作ramd模拟 (4/1150) patent 2015-12-03 2015-12-05 04:14:55 by smutao
[Gromacs ] [已完结]force-extension curve (0/315) th_ink28 2015-12-03 2015-12-03 00:16:04 by th_ink28
[Gromacs ] [已完结][关贴]很认真地求一名老师教我做毕业设计，有偿 (3/1312) judy-yjy 2015-12-01 2015-12-02 10:28:26 by jiezhou5322
[Gromacs ] [已完结]怎么做出文献中dssp的图 (0/1902) 心不留影 2015-12-02 2015-12-02 09:48:02 by 心不留影
[Gromacs ] [已完结][关贴]关于gromacs代码的一些疑问 (0/417) lwhvinson 2015-11-26 2015-11-26 22:40:22 by lwhvinson
[Gromacs ] [已完结]GROMACS运行完后的结果分析 (评阅+1) (4/1837) _蝶飞 2014-01-12 2015-11-26 11:54:14 by jikoukou
[Gromacs ] [已完结]请教径向分布概率的问题，感激不尽！！！！！！！ (5/1169) 白玉浴血 2015-11-21 2015-11-23 15:31:11 by lsloneil
[Gromacs ] [已完结]请问OPLS-AA全原子力场是怎么得到的呢？ (0/928) 白玉浴血 2015-11-23 2015-11-23 11:25:35 by 白玉浴血
[Gromacs ] [已完结]急求。PMF收敛问题求助 (评阅+1) (8/2935) yylcx 2015-03-19 2015-11-23 07:29:51 by 素君~~~
[Gromacs ] [已完结]NAMD中调用NAMD2总是出现NAMD2.EXE停止工作 (2/767) blacksep 2015-09-05 2015-11-21 12:30:28 by 楚云猛
[Gromacs ] [已完结]晶格热振动模拟问题 (1/494) xenapior 2015-11-20 2015-11-20 19:17:47 by xenapior
[Gromacs ] [已完结]模拟得到的自扩散系数小 (0/816) 雨里看雪 2015-11-20 2015-11-20 09:15:18 by 雨里看雪
[Gromacs ] [已完结]跑bmimscn的nvt 离子液体不聚合 求助 (0/298) M201571128 2015-11-17 2015-11-17 11:22:09 by M201571128
[Gromacs ] 填充的溶剂（比如水）需不需要实现经过系综条件下的平衡？ (0/218) 吉米爱多 2015-11-16 2015-11-16 19:46:11 by 吉米爱多
[Gromacs ] [已完结]amber 教程3.5中，无法生成复合体的参数文件 (7/1259) benniu2004 2015-11-13 2015-11-16 12:15:30 by hdx1991
[Gromacs ] [已完结]freeze某组分后跑npt (0/797) XYwinne 2015-11-15 2015-11-15 22:05:55 by XYwinne
[Gromacs ] [已完结]能量优化之后还是大于1000    ( 1 2 ) (评阅+1) (14/2407) aizazadi525 2015-11-06 2015-11-12 02:19:01 by awaken2013
[Gromacs ] [已完结]gromacs配体力场电荷的问题 (0/860) kangsgo 2015-11-11 2015-11-11 23:11:22 by kangsgo
[Gromacs ] [已完结]求助，gromacs在加溶剂时无法生成top文件。 (6/1390) tarmountain 2015-11-08 2015-11-10 07:37:55 by 默然~虫
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[Gromacs ] 在兰州的有哪位虫虫前辈用gromacs的？求指教 (1/481) jlsdyac 2015-10-21 2015-11-09 16:11:08 by fangsteel
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[Gromacs ] vmd的movie maker (1/1860) DONGTIANGE 2015-11-06 2015-11-09 02:03:02 by awaken2013
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