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zx66769185新虫 (初入文坛)
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学习用Gromacs进行蛋白质的粗粒化的简单教程后，对于任意体系的粗粒化产生了诸多疑问
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问题一：Gromacs 5.0是否自带了Martini力场？ 问题二：对于将蛋白质嵌入DPPC中，是如何将体系粗粒化的？换句话说，是将蛋白质粗粒化后嵌入，还是将蛋白质，DPPC分别粗粒化，再嵌入，还是将蛋白质嵌入DPPC中后再进行粗粒化？用在蛋白质以及DPPC上的力场又有什么不同？ 问题三：对于不同体系的粗粒化，需要注意哪些参数的改变？ 问题很多，请各路大神出手相助~~~~~在下感激不尽~~ |
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