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GROMACS跑完动力学后RDF分析和二面角随时间的变化
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| GROMACS跑完动力学后对结果rdf分析命令行如下：gmx rdf -f nvt.trr -s nvt.tpr -o nvt.xvg -b 0 -e 50000 -dt 100 -xvg none -bin 0.002 -selrpos mol_com,然后再都选取溶质分子，体系是水里面的平面分子，想看平面分子间的质心的RDF，看是否聚合。但是rdf的峰是出现在1埃处，vmd里看聚合的部分两个平面分子没有离这么近，不知道问题出在哪里。还有想看分子里的一个二面角随着时间的变化不知道怎么弄啊，请大神们指点下qaq |
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