| 查看: 1367 | 回复: 0 | |||
[求助]
GROMACS跑完动力学后RDF分析和二面角随时间的变化
|
| GROMACS跑完动力学后对结果rdf分析命令行如下:gmx rdf -f nvt.trr -s nvt.tpr -o nvt.xvg -b 0 -e 50000 -dt 100 -xvg none -bin 0.002 -selrpos mol_com,然后再都选取溶质分子,体系是水里面的平面分子,想看平面分子间的质心的RDF,看是否聚合。但是rdf的峰是出现在1埃处,vmd里看聚合的部分两个平面分子没有离这么近,不知道问题出在哪里。还有想看分子里的一个二面角随着时间的变化不知道怎么弄啊,请大神们指点下qaq |
» 猜你喜欢
售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有7人回复
售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上)
已经有10人回复
面上意见出来了
已经有4人回复
售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有9人回复
售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有9人回复









回复此楼