应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
81/1返回列表
查看: 1569  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?

gromacs水中的溶菌酶案例中,当选择力场后,出现Ｆile  input/output error,这个是什么原因?在蛋白质数据库下载file(text)格式还是file(gz)格式,下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?

溶菌酶.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
滴答
1楼 2012-10-10 16:48:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-10-11 10:20:30
你应该仔细阅读软件给你提示的错误信息，还有就是要认真读读手册。

你的错误提醒里，很清楚的写着“1AKI.pdb”
你再猜猜看，应该是什么格式。

“下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?”
这个问题，打个比方，你想吃饭的时候，你是去餐厅还是去图书馆？
要运行的输入文件肯定是要放在你的工作目录里啊？

这种问题，你还可以试一试，放在桌面，或者是gromacs文件夹，运行不了几个问题，就会很混乱。
一个问题，一个工作目录
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-10 21:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
滴答
3楼2012-10-11 08:48:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
内容已删除
回复此楼
滴答
4楼2012-10-11 10:21:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 赞 2012-10-11 10:50:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2012-10-11 08:48:42
我是新手,应该下载file(text)格式,但是文件应该放在gromacs下面哪个目录呢?...

其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gromacs进行运算时，直接输入 cd /home/XXX/simulation,意思就是在这个文件夹下进行操作，剩下的自己看看教程吧~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-10-11 10:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-10-11 10:23:35
其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gro ...

谢谢大侠,问题已经解决.
赞一下 回复此楼
滴答
6楼2012-10-11 16:55:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuchenchen

新虫 (初入文坛)
你好  我也遇到你这个问题  我该怎么解决呢  谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2015-08-11 15:43:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

庚晨绮梦

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wanglang1987 at 2012-10-11 16:55:00
谢谢大侠,问题已经解决....

请问，具体您是怎么操作的？
赞一下 回复此楼
fighting
8楼2016-03-07 21:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wanglang1987 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 26申博 +3 八旬速览 2026-03-16 3/150 2026-03-17 11:40 by nxgogo
[考研] 278求调剂 +3 Yy7400 2026-03-13 3/150 2026-03-17 08:24 by laoshidan
[考研] 0703化学336分求调剂 +3 zbzihdhd 2026-03-15 4/200 2026-03-16 23:52 by zbzihdhd
[考研] 东南大学364求调剂 +5 JasonYuiui 2026-03-15 5/250 2026-03-16 21:28 by 木瓜膏
[考研] 312求调剂 +3 陌宸希 2026-03-16 4/200 2026-03-16 15:06 by peike
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 材料专硕350 求调剂 +4 王金科 2026-03-12 4/200 2026-03-13 16:02 by ruiyingmiao
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭