应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
51/1返回列表
查看: 1794  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?

gromacs水中的溶菌酶案例中,当选择力场后,出现Ｆile  input/output error,这个是什么原因?在蛋白质数据库下载file(text)格式还是file(gz)格式,下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?

溶菌酶.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
滴答
1楼 2012-10-10 16:48:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 赞 2012-10-11 10:50:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2012-10-11 08:48:42
我是新手,应该下载file(text)格式,但是文件应该放在gromacs下面哪个目录呢?...

其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gromacs进行运算时，直接输入 cd /home/XXX/simulation,意思就是在这个文件夹下进行操作，剩下的自己看看教程吧~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-10-11 10:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-10-11 10:20:30
你应该仔细阅读软件给你提示的错误信息，还有就是要认真读读手册。

你的错误提醒里，很清楚的写着“1AKI.pdb”
你再猜猜看，应该是什么格式。

“下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?”
这个问题，打个比方，你想吃饭的时候，你是去餐厅还是去图书馆？
要运行的输入文件肯定是要放在你的工作目录里啊？

这种问题，你还可以试一试，放在桌面，或者是gromacs文件夹，运行不了几个问题，就会很混乱。
一个问题，一个工作目录
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-10 21:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-10-11 10:23:35
其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gro ...

谢谢大侠,问题已经解决.
赞一下 回复此楼
滴答
6楼2012-10-11 16:55:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

seuchenchen

新虫 (初入文坛)
你好  我也遇到你这个问题  我该怎么解决呢  谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2015-08-11 15:43:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 18:18 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 17:14 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 16:34 by xiangy672
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 14:03 by GkCVyODlx4mR
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[基金申请] 29号明天会评吗 +3 笨笨唐 2026-08-28 3/150 2026-08-30 09:29 by cww8181
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:39 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 07:28 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:48 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +4 349506619 2026-08-28 4/200 2026-08-29 22:41 by alongwaytogo
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +5 叶九微 2026-08-26 5/250 2026-08-27 10:35 by l_zh2008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭