应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?
51/1返回列表
查看: 1790  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)

[求助] gromacs水中的溶菌酶案例,哪出错了?

gromacs水中的溶菌酶案例中,当选择力场后,出现Ｆile  input/output error,这个是什么原因?在蛋白质数据库下载file(text)格式还是file(gz)格式,下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?

溶菌酶.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
滴答
1楼 2012-10-10 16:48:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

庚晨绮梦

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wanglang1987 at 2012-10-11 16:55:00
谢谢大侠,问题已经解决....

请问，具体您是怎么操作的？
赞一下 回复此楼
fighting
8楼2016-03-07 21:07:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-10-11 10:20:30
你应该仔细阅读软件给你提示的错误信息，还有就是要认真读读手册。

你的错误提醒里，很清楚的写着“1AKI.pdb”
你再猜猜看，应该是什么格式。

“下载完成后放在哪里?桌面还是gromacs文件夹?具体放在哪个文件夹呢?”
这个问题，打个比方，你想吃饭的时候，你是去餐厅还是去图书馆？
要运行的输入文件肯定是要放在你的工作目录里啊？

这种问题，你还可以试一试，放在桌面，或者是gromacs文件夹，运行不了几个问题，就会很混乱。
一个问题，一个工作目录
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-10 21:12:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 赞 2012-10-11 10:50:25
引用回帖:
3楼: Originally posted by wanglang1987 at 2012-10-11 08:48:42
我是新手,应该下载file(text)格式,但是文件应该放在gromacs下面哪个目录呢?...

其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gromacs进行运算时，直接输入 cd /home/XXX/simulation,意思就是在这个文件夹下进行操作，剩下的自己看看教程吧~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-10-11 10:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanglang1987

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zh1987hs at 2012-10-11 10:23:35
其实新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你还没有了解linux和win下操作的区别，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一个地方建个文件夹，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放进这个文件夹，然后要调用gro ...

谢谢大侠,问题已经解决.
赞一下 回复此楼
滴答
6楼2012-10-11 16:55:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 07:59 by gy1nBQXYQJqL
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-29 07:55 by popo0625
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 07:32 by winsaint
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭